Forskningsassistenter

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Två forskningsassistenttjänster inom ”Computational Genome Biology” är omedelbart tillgängliga i Bienko-Crosetto Lab för ”Quantitative Genome Biology” vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab) i Stockholm.

Bienko-Crosetto Lab är fokuserat på att utveckla och tillämpa banbrytande genomiska tekniker för att kartlägga den rumsliga organisationen av kromatinet i kärnan hos däggdjursceller, med det långsiktiga målet att förstå hur DNA-RNA-proteininteraktioner formar den högre ordningens kromatinarkitektur och orkestrera den under fysiologiska och patologiska förhållanden.

Som forskningsassistent kommer du att bidra till att analysera olika omics-dataset som vi kontinuerligt genererar i vårt labb och tillämpa avancerad bioinformatik för att modellera 3D-genomarkitekturen av enskilda celler.

Du kommer att vara en del av en dynamisk forskningsmiljö (https://bienkocrosettolabs.org/) där du kommer att arbeta tillsammans med seniora forskare, post-docs och doktorander från olika fält och bakgrunder, utveckla dina färdigheter, datorkunskaper och främja din kreativitet.

Din roll
Dina huvudsakliga arbetsuppgifter kommer att vara:

- Tillämpa tillgängliga pipelines för bearbetning av Hi-C- och GPSeq-datauppsättningar genererade i vårt labb
- Integrera GPSeq- och Hi-C-data som genererats i vårt labb med olika typer av allmänt tillgängliga omics-dataset (t.ex. ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq)
- Tillämpa och vidareutveckla Chromflock-mjukvaran som vi tidigare tagit fram för att göra 3D-genomrekonstruktion av enskilda celler genom att integrera Hi-C och GPSeq-data (se PMID: 32451505).
- Samarbeta med matematiker och teoretiska fysiker i vårt labb för att utveckla matematiska modeller av 3D-genomorganisation och dess dynamik i fysiologiska och patologiska tillstånd.

Vem är du?
Du har:

- En kandidat- eller masterexamen i fysik/matematik/bioteknik eller motsvarande.
- Dokumenterad tidigare praktisk erfarenhet av att analysera olika typer av NGS-data.
- Flytande i minst ett av följande programmeringsspråk: Unix/Bash/Python/C++/ Matlab/R.
- Förmåga att självständigt organisera din egen arbetsrutin och flexibelt anpassa ditt veckoschema till nya önskemål.
- En problemlösande och målmedveten personlighet, det vill säga att du är motiverad att lösa problem som kan finnas på vägen till att nå ett mål, du tycker om att felsöka, du är inte rädd för att söka hjälp och du kan hitta lösningar även om detta innebär att man reviderar det ursprungliga målet/planen (att aldrig kompromissa med vetenskaplig stringens och kvalitet).
- En stark samarbetsinställning, det vill säga att du är en stark lagspelare och vill bidra till hela lagets framgång.
- Flytande i både muntlig och skriftlig engelska.

Vad erbjuder vi?
En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.  

Placering: Solna,  SciLifeLab

Våra labb finns på Science for Life Laboratory (SciLifeLab) beläget på Karolinska Institutets campus i Stockholm. SciLifeLab är ett tvärvetenskapligt centrum för molekylär biovetenskap med fokus på hälso- och miljöforskning och samlar under samma tak grupper från fyra universitet: Karolinska Institutet, Kungliga Tekniska Högskolan, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret har toppmoderna teknologiplattformar, inklusive nästa generations sekvensering, ”high-throughput” histologi, superupplösningsmikroskopi, proteomik, bildanalys och bioinformatik.

 https://ki.se/om-ki/tio-skal-att-valja-karolinska-institutet



Ansökan
En anställningsansökan ska innehålla följande dokument på engelska:

- En fullständig meritförteckning, inklusive datum för BA- eller MSc-examen, certifiering av poäng och aktuell position.
- Personligt brev (max en sida) som beskriver tidigare arbetslivserfarenhet och varför Du vill jobba i Bienko-Crosetto Lab.
- Verifikationer för tillgodoräknande av sjukdom, militärtjänstgöring, arbete för fackföreningar eller studentorganisationer, föräldraledighet eller liknande omständigheter.
Välkommen med din ansökan!

Ansökan ska skickas in via Varbis rekryteringssystem.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss