Forskningsingenjör

Forskningsingenjör
vid Institutionen för genetik och patologi, Rudbecklaboratoriet.Tidsbegränsad anställning 1 år med tillträde snarast.

Institutionen för genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.genpat.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden.En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera närmare samarbete mellan kliniska och prekliniska forskare.Institutionen omsätter omkring 115 mkr och har ca 260 personer i sin arbetsstyrka, varav ca 60 är doktorander.Anställningen som forskningsingenjör är placerad vid Uppsala Genome Center som är en core facilitet för olika typer av storskalig analys av DNA vid Institutionen för genetik och patologi.

Arbetsuppgifter:
All verksamhet vid Uppsala Genome Center utförs på uppdrag från forskare från olika högskolor och universitet inom Sverige.Arbetet omfattar olika typer av DNA-analys som erbjuds rutinmässigt eller i enskilda projekt.Huvudsaklig arbetsuppgift är att etablera, utveckla och vara laborativt ansvarig för verksamhet baserad på ny teknologi för DNA-sekvensering.
Metoder som används:
Isolering av DNA:
Extraktion av DNA från olika typer av biologiskt material med automatiserad utrustning ABI6100.
Genotypning med mikrosatellitmarkörer:
Förbereda och planera genotypningsprojekt i samråd med uppdragsgivare.Uppsättning av PCR i 384-plattor.Förberedning av prover för elektrofores i ABI3730.PCR och poolning av PCR-produkter görs automatiserat.De instrument som används är EpMotion och Hydra.Analys och sammanställning data görs i GeneMapper v4.0.Sammanställning och editering av data i tabellform i Microsoft Excel.
Genotypning med SNP-markörer:
Förberedande av projekt, design av primers och prober.Uppsättning av PCR i 384-plattor.Hantering av instrument, ABI7900HT.
Efterföljande analys och sammanställning av data med SDS2.1 och Excel.
Sekvensering:
Primerdesign för PCR och sekvensering med PrimerExpress.Optimering av PCR- och sekvensreaktioner.Erfarenhet av sekvensering av olika typer av DNA-templat.
Editering och alignments av sekvensdata i Sequencher.Sammanställning av data.
Etablera ny sekvensmetod och vara ansvarig för sekvensering på ABI SOLiD.I arbetet ingår preparation av prover, handhavande av sekvenator (ABI SOLiD) och av övrig utrustning som används för provpreparation.

Kvalifikationskrav: Se universitetets hemsida www.uu.se under rubriken Lediga anställningar.

Önskvärt och eller/eller meriterande i övrigt
Vi söker en person som sätter hög serviceanda och noggrannhet främst.Arbetet kommer periodvis att kräva hög arbetsbelastning oregelbundna arbetstider, varför möjlighet till flexibla tider är önskvärt.

Universitetet eftersträvar en jämnare könsfördelning och män inbjuds särskilt att söka denna anställning.

Upplysningar om anställningen lämnas av Ulf Gyllensten, tel.
Om ansökan skickas per fax skall den kompletteras med originalhandling inom en vecka från ansökningstidens utgång.