Forskningsingenjör

Forskningsingenjör
vid Institutionen för genetik och patologi, Rudbecklaboratoriet.Vikariat med tillträde snarast till och med 2008-06-30.

Institutionen för genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.genpat.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden.En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera närmare samarbete mellan kliniska och prekliniska forskare.Institutionen omsätter omkring 115 mkr och har ca 260 personer i sin arbetsstyrka, varav ca 60 är doktorander.Vikariatet som forskningsingenjör är placerad vid Uppsala Genome Center som är en core facilitet för olika typer av storskalig analys av DNA vid Institutionen för genetik och patologi.

Arbetsuppgifter:
Arbete med olika typer av DNA-analys som erbjuds rutinmässigt eller i enskilda projekt.I arbetsuppgifterna ingår att ansvara för de instrument som används samt att vara ansvarig för datorer och programvaror som används i verksamheten.
Metoder som används i arbetet:
Isolering av DNA:
Extraktion av DNA från olika typer av biologiskt material med automatiserad utrustning ABI6100.
Genotypning med mikrosatellitmarkörer:
Förebereda och planera genotypningsprojekt i samråd med uppdragsgivare.Uppsättning av PCR i 384-plattor.Förberedning av prover för elektrofores i ABI3730.PCR och poolning av PCR-produkter görs automatiserat.De instrument som används är EpMotion och Hydra.Analys och sammanställning data görs i GeneMapper v4.0.Sammanställning och editering av data i tabellform i Microsoft Excel.
Genotypning med SNP-markörer:
Förberedande av projekt, design av primers och prober.Uppsättning av PCR i 384-plattor.Hantering av instrument, ABI7900HT.Efterföljande analys och sammanställning av data med SDS2.1 och Microsoft Excel.
Sekvensering:
Primerdesign för PCR och sekvensering med PrimerExpress.Optimering av PCR- och sekvensreaktioner.Erfarenhet av sekvensering av olika typer av DNA-templat.
Editering och alignments av sekvensedata i Sequencher.Sammanställning av data.
Tekniskt arbete
Driftsansvar och underhåll av teknisk apparatur; De instrument som främst används är Ep-Motion, Hydra, BioMek 2000, ABI3730, ABI7900HT.
Datarelaterat arbete
Driftsansvarig för de datorer som används i verksamheten, felsökning och åtgärder av de problem som uppstår.Ansvar för uppdatering av programvaror, säkerhetskopiering av data, etc.Uppdatering och underhåll av databas (Microsoft Acess).Uppdatering av webbsida.

Kvalifikationer: Se universitetets hemsida www.uu.se unde rubriken Lediga anställningar.

Önskvärt och/eller meriterande i övrigt:
Eftersom arbetet bedrivs i projektform och medför täta interaktioner med kunder och andra medarbetare, behöver du vara öppen som person och ha lätt att kommunicera med andra människor.Viktiga personliga egenskaper är flexibilitet och anpassningsförmåga eftersom variationen av arbetsuppgifter periodvis kommer att vara betydande.

Universitetet eftersträvar en jämnare könsfördelning och män inbjuds särskilt att söka denna anställning.

Upplysningar om anställningen lämnas av Ulf Gyllensten, tel.