Forskningsingenjör

Ändrade arbetsuppgifter

Forskningsingenjör vid Institutionen för genetik och patologi, Rudbecklaboratoriet.

Institutionen för genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.genpat.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom en rad områden. En av grundtankarna vid institutionens tillkomst var att stimulera närmare samarbete mellan kliniska och prekliniska forskare. Institutionen omsätter omkring 115 mkr och har ca 260 personer i sin arbetsstyrka, varav ca 60 är doktorander. Anställningen som forskningsingenjör är placerad vid Uppsala Genome Center som är en corefacilitet för olika typer av storskalig analys av DNA vid Institutionen för genetik och patologi.

Arbetsuppgifter: All verksamhet vid Uppsala Genome Center utförs på uppdrag från forskare från olika högskolor och universitet inom Sverige. Arbetet omfattar olika typer av DNA-analys som erbjuds rutinmässigt eller i enskilda projekt. Metoder som används:

. Isolering av DNA: Extraktion av DNA från olika typer av biologiskt material med automatiserad utrustning ABI6100.

. Genotypning med mikrosatellitmarkörer: Förbereda och planera genotypningsprojekt i samråd med uppdragsgivare. Uppsättning av PCR i 384-plattor. Förberedning av prover för elektrofores i ABI3730. PCR och poolning av PCR-produkter görs automatiserat. De instrument som används är EpMotion och Hydra. Analys och sammanställning data görs i GeneMapper v4.0. Sammanställning och editering av data i tabellform i Microsoft Excel.

. Genotypning med SNP-markörer: Förberedande av projekt, design av primers och prober. Uppsättning av PCR i 384-plattor. Hantering av instrument, ABI7900HT. Efterföljande analys och sammanställning av data med SDS2.1 och Excel.

. Sekvensering: Primerdesign för PCR och sekvensering med PrimerExpress. Optimering av PCR- och sekvensreaktioner. Erfarenhet av sekvensering av olika typer av DNA-templat. Editering och alignments av sekvensdata i Sequencher. Sammanställning av data.

Kvalifikationskrav: Erfarenhet av de laborativa metoder som ingår. Vana vid hantering av instrument som används; främst Hydra och ABI3730. Erfarenhet av de programvaror som används för analys av data, främst GeneMapperv4.0 för fragmentsdata och Sequencer för sekvensdata. God erfarenhet av Microsoft Excel som används för editering och sammanställning av storskalig data i tabellform. Som medarbetare i Uppsala Genome Center krävs att man har regelbunden kontakt med de kunder vi utför uppdrag åt. Som person bör man vara öppen och ha lätt att kommunicera med andra människor. Förmåga att ta egna initiativ, arbeta självständigt och ta eget ansvar i kombination med logiskt tänkande och god analytisk förmåga är ett krav. Stor vikt kommer att fästas vid personlig lämplighet.

Önskvärt och eller/eller meriterande i övrigt: Vi söker en person som sätter hög serviceanda och noggrannhet främst. Arbetet kommer periodvis att kräva hög arbetsbelastning oregelbundna arbetstider, varför möjlighet till flexibla tider är önskvärt.

Uppsala universitet har ambitionen att främja jämställdheten genom en jämnare könsfördelning. Flertalet anställda inom denna kategori är kvinnor varför vi gärna ser män som sökande till anställningen.