Forskningsingenjör

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med drygt 35 000 studenter och 4 200 anställda.  Här finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden. Umeå universitet är också platsen för den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 – en revolution inom gentekniken som tilldelats Nobelpriset i kemi.

Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur där vi gläds åt varandras framgångar.




Umeå Plant Science Centre (UPSC) är ett internationellt erkänt centrum för grundforskning om växter.

Vi söker nu en forskningsingenjör som kommer att fungera som specialist inom bioinformatik och ha en koordinerande funktion i sekvenseringsprojekt, samt vara organisatör i vår Bioinformatikfacilitet. Anställningen är på heltid och tidsbegränsad till 12 månader. Tillträde 2022-01-01 eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag är 2021-10-08.

Beskrivning
UPSC:s forskning på modellorganismen Arabidopsis thaliana och träd (främst gran och asp) innebär små- och storskaliga sekvenseringsprojekt. Sekvenseringsdelen av dessa projekt hanteras oftast av Swedish National Genomics Infrastructure (NGI) och kräver därför regelbunden digital kommunikation.

Arbetsuppgifter
I rollen som forskningsingenjör kommer du att stödja och underlätta upprättandet av sekvenseringsprojekt, främst för UPSC men även fungera som NGI-kontaktperson i Umeå, för universitetet, Norrlands universitetssjukhus och Sveriges lantbruksuniversitet (SLU). Detta och koordineringen av arbetet inom bioinformatikfaciliteten motsvarar omkring hälften av arbetstiden, resten utgör olika analysuppgifter inom faciliteten. Som kontaktperson kommer du att informera om NGI:s aktiviteter och kompetenser samt organisera sekvenseringsprojekt för intresserade forskningsledare.

Regelbundna resor till NGI:s kontor kommer att ingå i arbetet. I rollen kommer du att utveckla en webresurs för att möjliggöra för forskningsledare att följa projektens status, tidsplanering och kostnader. I arbetet vid Bioinformatikplattformen kommer du att vara involverad i att processa och analysera sekvenseringsdata genom att använda vår befintliga analyspipeline.

Kvalifikationer
Vi söker dig som har civilingenjörsexamen inom bioteknik med inriktning mot bioinformatik eller motsvarande och som har kunskap inom datavetenskap eller bioinformatik. Tidigare erfarenhet av pipeline-mjukvara såsom nextflow eller snakemake är en fördel. Erfarenhet av Unix, programmeringsspråk såsom Python är nödvändigt. Kunskap om Next-generation sekvenseringsteknologier och hur de används är ett krav och användarvana är en fördel. Du behöver ha god förmåga att tala och skriva på engelska. Du har även god kommunikationsförmåga, är kreativ och kan arbeta väl såväl i grupp som självständigt. Kännedom om NGI:s rutiner är en merit.

Villkor

Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till 1 år. Tillträde 2022-01-01 eller enligt överenskommelse.

Ansökan

Ansökan skall innehålla (1) ett personligt brev (2) CV med full publikationslista och kopior på relevanta examen (3) en beskrivning av forskningserfarenhet (4) Redogörelse för forskningsintresse.

Vid frågor om anställningen, vänligen kontakta Stefan Jansson via e-post stefan.jansson@umu.se eller telefonnummer 090-786 53 54.

 

Välkommen med din ansökan!

Institutionen för fysiologisk botanik är en del av Umeå Plant Science Centre med cirka 200 medarbetare som består av bland annat av 40 gruppledare och representerar för närvarande 48 olika nationaliteter (för mer information, se http://www.upsc.se eller http://www.plantphys.umu.se/english/). Vår huvudsakliga verksamhet är akademisk forskning och utbildning som innefattar områden som ekologi, biokemi, plant fysiologi samt genomik.

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.


Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.