Forskningsingenjör

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 45 000 studenter, 6 800 anställda och en omsättning på 6,3 miljarder kronor.



Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.

igp.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, diabetes och molekylär diagnostik. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, bioinformatik, patologi, tumörbiologi, vaskulärbiologi samt strålningsvetenskap. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskaplig fakultet. Institutionen omsätter omkring 300 mkr varav drygt hälften är externa forskningsbidrag och har ca 340 anställda, varav ca 116 är doktorander, och totalt över 600 verksamma i sin arbetsstyrka.

Anställningen är placerad vid den nationella sekvensplattformen, (NGI-Uppsala/Uppsala Genome Center). NGI är en teknikplattform inom SciLifeLab med uppdrag att utföra storskalig DNA sekvensering som service åt forskargrupper över hela landet. 

Arbetsuppgifter
Vi söker medarbetare som ska delta i det laborativa arbetet med olika DNA-sekvensmetoder. Detta innefattar s.k. Massiv Parallell DNA-sekvensning (MPS) med teknologier från Thermo-Fisher (Ion Torrent) och Pacific Biosciences (PacBio RSII) och Sangersekvensning (ABI 3730XL). Arbetet innefattar ankomstkontroll och provberedning av DNA- och RNA prover för sekvensanalys. Provberedning sker manuellt eller automatiserat med datorstyrda pipetteringsrobotar (Hamilton Starlet och Agilent Bravo Liquid Handler). Förutom sekvensning utförs extraktion av DNA från olika typer av biologiskt material och genotypning av STR och SNP-markörer. Arbetet innefattar också hantering, underhåll och vid behov felsökning av de instrument som används i verksamheten. Vissa datorrelaterade uppgifter ingår i arbetet, såsom användning av MiniLims (BioTeam) för registrering av projekt, prover och arbetsflöden, editering och alignment av Sanger sekvensdata i Variant Reporter eller Geneious, samt analys och sammanställning av insamlad data i GeneMapper för fragmentdata och SDS2.3 för SNP-data. Utveckling av funktioner i Microsoft Excel för att underlätta dokumentation av provflöde, provhantering och sammanställningar av data. I ökad omfattning kommer även bearbetning av MPS-data att ingå i arbetsuppgifterna.

Kvalifikationer
Högskoleexamen inom biologi, molekylärbiologi eller bioteknik. Erfarenhet av arbete med provberedning och instrument för DNA sekvensbestämning med hjälp av MPS teknologier, ffa Ion Torrent och Pacific Biosciences, eller Sangersekvensning. Goda kunskaper i användning av Microsoft Office, särskilt meriterande är avancerade kunskaper i Microsoft Excel. Erfarenhet av UNIX-baserade program, arbete med SQL-databaser. Arbetet innebär att kontinuerligt lära sig hantera nya instrument och att lära sig nya metoder och protokoll för provberedning. Ett krav är förmåga att med egna initiativ och självständighet utföra arbetet enligt uppdrag samt att ta ansvar för utfört arbete gentemot uppdragsgivare. Vi ser gärna att sökande har dokumenterad erfarenhet av självständigt arbete. God förmåga att kommunicera på svenska och engelska i tal och skrift är ett krav då återkommande kontakt och kommunikation med de forskare som vi utför uppdrag åt är en viktig del av verksamheten. Stor vikt kommer att fästas vid personlig lämplighet.

Vi söker medarbetare som är utåtriktade, resultatorienterade och som trivs att arbeta i grupp. Vi ser gärna sökande med erfarenhet från arbete i liknande form av uppdragsverksamhet. Erfarenhet av arbete inom ackrediterad verksamhet är meriterande, då UGC f.n. genomgår en ackrediteringsprocess. Arbetet kommer periodvis att medföra hög arbetsbelastning varför möjlighet till flexibla arbetstider är önskvärt. Intresse för problemlösning av teknisk natur är meriterande.

Meriterande: Kunskap eller intresse för genetik, medicin eller biologi i allmänhet är meriterande. Sökande behöver god arbetsdisciplin och noggrannhet, och en förståelse för datasäkerhetsaspekter rörande patientdata och genetisk information. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas. Ange löneanspråk i ansökan.

Tillträde: Snarast eller efter överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning vikariat t.o.m. 2016-09-30, med möjlighet till förlängning.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av:
Inger Jonasson, e-post inger.jonasson@igp.uu.se

Välkommen med din ansökan senast 9 februari 2016, UFV-PA 2016/33. 

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.