Forskningsingenjör

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 7 000 anställda och en omsättning på 6,5 miljarder kronor.



Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.

igp.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, diabetes och molekylär diagnostik. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, bioinformatik, patologi, tumörbiologi, vaskulärbiologi samt strålningsvetenskap. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskaplig fakultet. Institutionen omsätter omkring 300 mkr varav drygt hälften är externa forskningsbidrag och har ca 340 anställda, varav ca 120 är doktorander, och totalt över 600 verksamma i sin arbetsstyrka.

Arbetsuppgifter:
Forskningsingenjören kommer att driva självständiga projekt inom bioinformatik och utföra dataanalys av gener som har betydelse för hjärntumörutveckling som drabbar barn och vuxna. I arbetsuppgifterna ingår att ansvara för genetiska analys som görs i Fredrik Swartlings, Lene Uhrboms och Bengt Westermarks lab inom neuroonkologi-programmet vid inst. för immunologi, genetik och patologi. Forskningsingenjören kommer framför allt att analysera data från expressionsstudier, sekvenseringsstudier och metyleringsarrayer som erhålls från bearbetad analys från DNA och/eller RNA isolerad från tumörprover från både djur och människa. I uppgifterna ingår även projektdesign, matematisk/statistisk analys och mer avancerad programmering för genetisk analys och systembiologi.
Forskningsingenjören kommer att erbjudas arbetsplats på skrivrum i Rudbecklaboratoriets lokaler för sin anställning. Forskningsingenjören kommer att stå till förfogande för ytterligare arbetsuppgifter som undervisning inom bioinformatik inom cancer för grundutbildning eller utföra bioinformatisk analys på uppdrag av forskare, postdoks eller doktorander i Swartling, Westermarks eller Uhrboms forskargrupper på institutionen samt vissa administrativa uppgifter på institutionen.


Kvalifikationskrav:
Civilingengörsutbildning inom bioinformatik eller motsvarande. Minst 2 års erfarenhet av bioinformatisk, cancergenetisk forskning eller motsvarande forskningsområde. Goda kunskaper av att analysera RNA-sekvensdata och av arraybaserad expressionsanalys, molekylär klassificering/klusteranalys, cross-specieanalys, variantdetektion och olika former av pathwayanalys. Goda kunskaper av programmering i JAVA, Python, Bash, Perl, MATLAB och R samt i arbete i operativsystemet Linux och UNIX. Goda kunskaper av att jobba i UPPMAX-systemet.


Önskvärt/meriterande i övrigt:
Särskild vikt kommer att läggas vid vetenskaplig excellens inom forskningsfältet, goda samarbetsegenskaper samt personlig lämplighet.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast.

Anställningsform: Tillsvidareanställning, provanställning kan tillämpas alternativt.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av 
Fredrik Swartling, 018-471 4868, fredrik.swartling@igp.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 7 maj 2017, UFV-PA 2017/1133.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.