Forskningsingenjör, bioinformatiker med fokus på komparativ genetik

Institutionen för husdjurens biovetenskaper
Vi söker en forskningsingenjör i syfte förbereda framtida projekt inom utvecklingen av rasspecifika pangenom för kor.

Om jobbet
Arbetet går ut på att uppdatera de arbetsflöden som vi planerat använda inom projektet ”Breedmaps - Rasspecifika kogenom för ökad produktivitet.”. Utvecklingen av den tredje generationens sekvenseringsteknik speglas även inom bioinformatik med nya programvaror och lösningar för att sekvensera och jämföra olika raser. Därför söker vi en forskningsingenjör för att praktiskt arbeta med att identifiera strukturella variationer hos kor som redan sekvenserats samt förbereda kommande arbete med nya prover.

För att utveckla arbetet med storskalig genotypering och fenotypering arbetar vi inom projektet med utveckling på tre fronter där ditt fokus kommer att ligga på de två sistnämna punkterna.
1. Bättre verktyg för storskalig mätning av djurs egenskaper.
2. Mer detaljerade kartor över genetisk mångfald hos olika (ko)raser.
3. Bättre verktyg för att återanvända och dela analysflöden som används för att analysera data.

Din bakgrund 
Vi söker en person som läst kurser inom bioinformatik och med viss tidigare erfarenhet från forskningsarbete. Du ska kunna arbeta självständigt och ha ett intresse av helgenomsekvensering samt komparativ genomik. Arbetet utgör ett kortare projekt för att förbereda arbete som genomförs av studenter och är lämpligt för en student under den andra halvan av sin studietid. Den sökande skall obehindrat kunna skriva och kommunicera på svenska och engelska.

Om oss
Som forskningsingenjör kommer du att arbeta på sektionen för kvantitativ genetik på institutionen för husdjurens biovetenskaper. Inom sektionen arbetar vi mycket med genomisk selektion och egenskaper som bäst beskrivs med den infinitesimala genmodellen vilken används bland annat för genomisk selektion inom avelsarbete. Arbetet kommer att ske under den andra halvan av sommaren i syfte att förbereda studentprojekt som kommer att genomföras under hösten. 

Institutionen är en del av fakulteten för Veterinärmedicin och husdjursvetenskap och ansvarar för utbildning och forskning inom flera grundläggande och tillämpade vetenskapliga områden. Dessa områden omfattar anatomi, fysiologi, biokemi, patologi, farmakologi, toxikologi, genetik, avel, immunologi, bakteriologi, virologi, parasitologi, epizootologi, komparativ medicin, livsmedelssäkerhet, bioinformatik och One Health.

Mer information om institutionen/avdelningen: https://www.slu.se/institutioner/husdjursgenetik/om-institutionen/kvantitativ-genetik/molbio2/

Mer information om den vetenskapligt ansvarige för projektet: https://www.slu.se/cv/tomas-klingstrom/ 

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba vid SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Placering:
Campus Ultuna

Anställningsform:
Tidsbegränsad anställning 1 månader

Omfattning:
100%

Tillträde:
Enligt överenskommelse

Ansökan:
Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast 2024-08-12.

Fackliga kontaktpersoner:
https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/

 


Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen för hållbart liv, grundad i vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspelen mellan människa, djur och ekosystem och ett ansvarsfullt brukande av naturresurserna bidrar vi till en hållbar samhällsutveckling och goda livsvillkor på vår planet. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet.

SLU har drygt 3000 medarbetare, 5000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över tre miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden. Vi arbetar för en jämställd och inkluderande arbetsmiljö där öppna samtal mellan människor med olika erfarenheter lägger grunden för vetenskaplighet, kreativitet och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och perspektiv att söka den aktuella anställningen.