Första forskningsingenjör inom bioinformatik/webbutveckling

Arbetsbeskrivning

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.


Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om – och mitt i – ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.


Är du intresserad av att veta mer? https://www.umu.se/jobba-hos-oss/om-universitetet-som-arbetsplats/


 




Första forskningsingenjör inom bioinformatik /webbutveckling 
Umeå Plant Science Center (UPSC) är en av Europas starkaste forskningsmiljöer för växtgrundforskning(www.

upsc.se). Vårt gemensamma mål är att förstå växternas anpassningsförmåga och acklimatisering till en föränderlig omvärld.

Institutionen för fysiologisk botanik (www.umu.se/institutionen-for-fysiologisk-botanik), som utgör en av parterna i UPSC, söker en första forskningsingenjör som kommer att arbeta med bioinformatisk webbutveckling. Anställningen är tillsvidare med tillträde omgående eller enligt överenskommelse.

Projektbeskrivning och arbetsuppgifter
Du kommer att arbeta i en gemensam forskningsmiljö vid institutionen för fysiologisk botanik i samarbete med team på UPSC bioinformatikanläggning, National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS), programmet Data Driven Life Science (DDLS) och Vlaams Instituut voor Biotechnologie (VIB) , Gent, Belgien. Ett aktuellt fokus för positionen kommer att ligga på genomprojektet av gran och tall och att stödja behoven av webbresursinfrastruktur hos forskargrupper vid UPSC. I arbetet ingår utveckling av webbresursen PlantGenIE.org. Det kommer att finnas ett antal milstolpar i utvecklingen, inklusive integrationen av DNA-sekvenseringsdata från hela populationer, data från genomomfattande associationsstudier (GWAS), genuttrycksdata och genuttrycksnätverk, inklusive nya analys- och visualiseringsverktyg. Arbetet kommer att fokusera på att tillämpa principer från människa-datorinteraktion och designfilosofi för att förbättra användbarheten (UX) och användargränssnittet (UI) för PlantGenIE och på utveckling av API:er för att öka FAIR-efterlevnaden. I denna del av arbetet kommer du att använda dig av webbanalys och användarundersökningar för att kunna fatta välgrundade designbeslut.

Kvalifikationer
Doktorsexamen i bioinformatik, datavetenskap, människa-datorinteraktion eller motsvarande krävs. Den sökande ska ha arbetslivserfarenhet inom bioinformatik, webbdesign och interaktion mellan människa och dator. Erfarenhet av mjukvaruutveckling och/eller avancerad programmering i skriptspråk (som Python) samt lång och dokumenterad erfarenhet av webbutveckling, inklusive användardriven gränssnittsdesign och tillämpning av webbanalysverktyg krävs också. Goda kunskaper i engelska i tal och skrift är ett krav, samt god samarbetsförmåga och förmåga att tänka kreativt, samarbeta i grupp och ta egna initiativ.

Dokumenterad erfarenhet av webbgränssnittsutveckling, databasdesign, arbete i UNIX-miljö och med datorkluster är meriterande. Bekantskap med någon av ReactJS, gosling.js, Neo4j, php och liknande webbteknologier är mycket fördelaktigt. Erfarenhet av analys och visualisering av nästa generations sekvenseringsdata (t.ex. RNA-sekvenseringsdata och gennätverk) är också meriterande liksom förståelse för grundläggande molekylärbiologi. Vi använder Git flitigt så förtrogenhet med koddelningssystem är önskvärt och kommer att vara en nödvändig arbetsrutin.

Ansökan
Ansökan ska innehålla:

- Ett personligt brev där du beskriver dig själv, och dina tidigare relevanta forskningserfarenheter. Brevet ska innehålla länkar till dina tidigare arbeten inom webbutveckling, användargränssnitt och webbdesign som kan visa varför du är kvalificerad för anställningen max 2 sidor).
- CV
- Styrkt kopia av doktorsexamensbevis
- En publikationslista inklusive en länk till din doktorsavhandling.
- Styrkta kopior av betyg och examensbevis.
- Övriga handlingar du vill åberopa.

Du ansöker via vårt e-rekryteringssystem. Ansök via knappen längst ner på sidan. Sista ansökningsdag är 2023-09-13. 

För mer information, vänligen kontakta universitetslektor Nathaniel Street, +46-(0)90-786 5473, nathaniel.street@umu.se. 

Välkommen med din ansökan! 

Institutionen för fysiologisk botanik är en del av Umeå Plant Science Centre med cirka 200 medarbetare som består av bland annat av 40 gruppledare och representerar för närvarande 48 olika nationaliteter (för mer information, se http://www.upsc.se eller http://www.plantphys.umu.se/english/). Vår huvudsakliga verksamhet är akademisk forskning och utbildning som innefattar områden som ekologi, biokemi, plant fysiologi samt genomik.

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.


Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.

Kontaktpersoner på detta företaget

Fredrik Almqvist
090-786 69 25
Michael Holmboe
090-7865248
Rainer Backman, professor (huvudhandledare)
090-786 59 43
Torbjörn Lestander, docent
090-786 87 95
Ewa Mellerowicz, professor
090-786 83 67
Thomas Olofsson
090-786 67 10
Åke Fransson
090-786 50 33
Jonatan Klaminder, jonatan.klaminder@emg.umu.se
090-786 9554
Henrik Larsson
090-786 79 97, 070-825 59 51
Christer Nilsson, christer.nilsson@umu.se
090-7866003

Sammanfattning

Besöksadress

Umeå universitet
None

Postadress

Umeå universitet
Umeå, 90187

Liknande jobb


Forskningsassistent: Klinisk noggrannhet hos AI inom bröstradiologi

Forskningsassistent: Klinisk noggrannhet hos AI inom bröstradiologi

20 december 2024

Staff scientist inom metagenomik

5 december 2024