Förste forskningsingenjör, 12 månader 50%, inom bioinformatik

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 100 medarbetare och 34 000 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.




Umeå Plant Science Center (UPSC) är en av Europas starkaste forskningsmiljöer for växtgrundforskning inbegripande forskning om växternas ekologi, genetik, cellbiologi, molekylärbiologi och fysiologi (se www.

upsc.se).Vi söker en förste forskningsingenjör vid Institutionen för fysiologisk botanik, som är en del av Umeå Plant Science Centre. Anställningen är på 50% under 12 månader . Start oktober 2020 eller enligt överenskommelse.

Projektbeskrivning och arbetsuppgifter

Umeå Plant Science Centre (UPSC) är ett internationellt erkänt centrum inom området växtgrundforskning. UPSCs forskning på modellorganismen Arabidopsis thaliana och träd såsom gran och asp innebär små- och storskaliga sekvenseringsprojekt. UPSC har en bioinformatikplattform: UPSCb som är specialiserad i dataanalysen av dessa sekvenseringsprojekt. Att arbeta vid Bioinformatikplattformen innehåller att vara involverad i att processa och analysera sekvenseringsdata genom att använda våra befintliga analyspipelines och utveckla nya pipelinar.

Du kommer att arbeta med: (i) analys av High Throughput Sequencing (i huvudsak RNA-seq) data - dvs användning av vår pipeline för dataförbehandling, kvalitetskontroll, resultatframställning och presentation. I vissa fall blir du mer delaktig i vissa forskningsprojekt, till exempel genom att vid analysen samarbeta med forskare med mindre bioinformatikkompetens; (ii) att hjälpa biologer med att t.ex. söka sekvens homologer, utföra fylogenetiska analyser osv; (iii) att hålla dig uppdaterad med de senaste teknikerna inom programvaror och verktyg; (iv) samt att utveckla pipelines för analys av NGS data, liknande vår RNA-Seq pipeline, t.ex. för ChIP-Seq, sRNA-Seq, ncRNA-Seq eller metagenomik.

Kvalifikationer

Doktorsexamen inom beräkningsbiologi, bioinformatik eller motsvarande. Väl bekant med Unix/Linux och minst ett programmeringsspråk såsom Python, R, C eller C++. God kunskap i att interagera med biologer, mycket god kunskap i engelska. Mycket god förmåga att självständigt organisera och rapportera arbetet är en förutsättning för anställning.

Erfarenhet av NGS teknik, särskilt RNA-Seq och ChIP-Seq, dessutom kunskap av small och lncRNA biology och statistik är meriterande

Ansökan

Ansökan ska innehålla:

- Ett personligt brev där du beskriver dig själv och dina forskningsintressen samt varför du är intresserad av och lämpad för anställningen.
- Curriculum vitae (CV) samt lista över publicerade vetenskapliga artiklar
- Verifierade kopior av betyg och examensbevis
- Kopior på relevanta arbeten som avhandlingar eller publikationer
- Kontaktuppgifter till minst två referenspersoner

Du ansöker via vårt e-rekryteringssystem. Logga in och ansök via knappen längst ner på webbsidan. Välkommen med din ansökan senast 2020-09-28. Alla bifogade dokument ska vara i MS Word eller PDF format.

För mer information, vänligen kontakta Nicolas Delhomme (nicolas.delhomme@umu.se)

Välkommen med din ansökan!

 

Institutionen för fysiologisk botanik är en del av Umeå Plant Science Centre med cirka 200 medarbetare som består av bland annat av 40 gruppledare och representerar för närvarande 48 olika nationaliteter (för mer information, se http://www.upsc.se eller http://www.plantphys.umu.se/english/). Vår huvudsakliga verksamhet är akademisk forskning och utbildning som innefattar områden som ekologi, biokemi, plant fysiologi samt genomik.

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.


Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.