Förste forskningsingenjör (24 månader)

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 300 medarbetare och 31 500 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.



Institutionen för fysiologisk botanik som är en del av Umeå Plant Science Centre, ett världsledande centrum för experimentell växtbiologi (www.

upsc.se), söker en förste forskningsingenjör för att undersöka reglering av blomningstid i Arabidopsis thaliana genom genomiska metoder.

Beskrivning
Huvuddelen av vår föda och djurfoder härstammar – direkt eller indirekt – från växter och det är därmed viktigt att förstå vilka faktorer som styr och påverkar växtproduktionen. En viktig reglerande faktor för produktion av många växter är tidpunkten (framför allt dagslängden) för blomning. I detta projekt undersöker vi bZIP transkriptionsfaktorn FD:s roll vid reglering av blomningstiden i Arabidopsis thaliana. Vi kommer att använda chromatin immuno presipitation kopplad till ”high-throughput sequencing” (ChIP-seq) och transkriptom analyser (RNA-seq) för att bestämma FD:s målgener i skottmeristem. Dessutom bestämmer vi hur FD: s aktivitet moduleras av FT-proteinet, vilket har visat sig fungera som en ”florigen” i växter.

Anställningen är på heltid (100%) och tidsbegränsad till två år.Tillträde 1 oktober 2017 eller enligt överenskommelse.

Arbetsuppgifter
Arbetsuppgifterna omfattar generering av transgena Arabidopsis thaliana för att studera effekten av gener på blomningstid. I arbetet ingår molekylär och biokemisk karakterisering av växter med förändrad blomningstid, särskilt chromatin immuno presipitation kopplad till High-Throughput Sequencing (ChIP-seq) och transkriptomanalyser (RNA-seq). Vidare ingår High-Throughput Sequencing dataanalyser inklusive dataförbehandling, kvalitetskontroll och resultatframställning.

Kvalifikationer
Du har doktorsexamen inom biologi, bioteknik eller biokemi eller motsvarande och postdoktoral erfarenhet inom växtutvecklingsbiologi och genomik. Det är meriterande om du har erfarenhet av analys av blomningstid i Arabidopsis thaliana. Kunskaper i molekylärbiologiska metoder för att analysera DNA-protein-interaktioner, såsom EMSA och ChIP är en förutsättning. Goda kunskaper inom NGS dataanalys (ChIP-seq och RNA-seq) med användning av operativsystemet Linux, "R" statistiska beräkningar, och Python programmering är krävs. Förmåga att självständigt organisera och rapportera arbetet är en förutsättning för anställning. Goda kunskaper i engelska (muntligt och skriftligt) är ett krav och vi värdesätter kreativitet och initiativförmåga.

Ansökan
Ansökan skall innehålla (1) ett personligt brev (2) CV med full publikationslista och kopior på relevanta examen (3) en beskrivning av forskningserfarenhet (4) Redogörelse för forskningsintresse (5) Kontaktinformation till två referenspersoner.

Institutionen för fysiologisk botanik är en del av Umeå Plant Science Centre med cirka 200 medarbetare som består av bland annat av 40 gruppledare och representerar för närvarande 48 olika nationaliteter (för mer information, se http://www.upsc.se eller http://www.plantphys.umu.se/english/). Vår huvudsakliga verksamhet är akademisk forskning och utbildning som innefattar områden som ekologi, biokemi, plant fysiologi samt genomik.

Umeå universitet vill erbjuda en miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vid varje rekrytering strävar vi efter ökad mångfald och använder möjligheten till positiv särbehandling.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.