Förste forskningsingenjör

Kemiska institutionen har ca 210 anställda. Institutionen bedriver forskning och utbildning samt har en omfattande samverkan med omgivande samhälle. För mer information, se www.chemistry.umu.se.

Som förste forskningsingenjör kommer du att knytas till Computational Life Science Cluster (CLiC, www.clic-umu.se), bioinformatikplattformen vid Umeå universitet med för närvarande 35 forskare från flera institutioner och centrumbildningar vid Tekniska naturvetenskapliga fakulteten samt Medicinska fakulteten.

Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till fyra månader. Tillträde snarast eller enligt överenskommelse.

Huvudsakliga arbetsuppgifter
I anställningen ingår främst att utveckla nya beräkningsstrategier och statistiska strategier för analys av storskaliga datamängder och designa pipelines för dataanalys och dataintegration med fokus på proteinbioinformatik. Arbetet kommer att omfatta inrättande av infrastruktur och pipelines för hantering, analys och lagring av storskaliga proteinsekvens- och proteinstrukturdata samt tillämpning av olika maskininlärningsmetoder och att utveckla nya algoritmer. Särskilt fokus ligger på identifiering och analys av oordnade aminosyraintervaller i proteiner, prediktion av effekten av mutationer på proteinets stabilitet, aktivitet och potential att förorsaka sjukdom, proteinveckning och proteinstrukturprediktioner.

Kompetenskrav
Du ska ha doktorsexamen inom bioinformatik eller motsvarande kompetens och väldokumenterad forskningserfarenhet inom detta område, speciellt inom utveckling av algoritmer för analys av proteinsekvens, proteinstruktur och proteinveckning och stabilitetsdata. Du har erfarenhet av hantering av proteinsekvens- och proteinstrukturdata samt data från proteinvecknings- och stabilitetsexperiment. Vidare ska du vara väl bekant med de vanligaste maskininlärningsmetoder, såsom hidden Markov models, Support Vector Machines, Conditional Random Fields och Random Forests. Dessutom krävs gedigna kunskaper inom statistik och multivariat dataanalys. God kunskap i programmeringsspråk (C + +, C, Java, Python, Perl, ASP, PHP, XML, SQL) är viktigt. Det är viktigt att du har har stor erfarenhet i hur man planerar, sätter upp och bedriver ett databassystem. Praktisk erfarenhet av olika databassystem (MySQL, MS SQL Server, Sybase ASE 12.5, MS-Access) och av DB konstruktion och underhåll samt analys av stora datamängder krävs. God kännedom om de vanligaste operativsystem (Linux, Windows (XP och 7) samt Windows Server 2000) är ett krav.

Du ska mycket goda kunskaper inom organisation och kommunikation samt uppvisa god samarbetsförmåga. Arbetet kräver vidare goda kunskaper i engelska.

Övriga önskvärda kvalifikationer
Meriterande är erfarenhet av projektledning. Att ha publicerat i nämnda forskningsområden är önskvärt.


Till ansökan ska bifogas (1) en meritförteckning (CV), (2) kopior av examensbevis och publikationer, (3) namn och kontaktuppgifter till minst två referenspersoner samt (4) ett följebrev med motivering.

Närmare upplysningar lämnas av universitetslektor Uwe H. Sauer, 090-786 59 30, uwe.sauer@chem.umu.se

Facklig information lämnas av Saco-S, 090-786 53 65, SEKO, 090-786 52 96 samt ST, 090-786 54 31.



Din ansökan skall vara inkommen till Umeå universitet senast 2014-01-31.