Förste forskningsingenjör vid institutionen för fysiologisk botanik

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 300 medarbetare och 31 500 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.



Institutionen för fysiologisk botanik, en av institutionerna inom Umeå Plant Science Centre (UPSC), söker en förste forskningsingenjör för att undersöka de grundläggande molekylära mekanismerna för florigen FLOWERING LOCUS T(FT)-funktion och dess interagerande proteiner.

Anställningen avser heltid och två år med tillträde den 1 oktober 2015 eller enligt överenskommelse.


Projektbeskrivning

Syftet med detta projekt är att förstå hur MADS-domän-transkriptionsfaktorerna FLM, MAF1 (FLOWERING LOCUS M; MADS AFFECTING FLOWERING 1 (MAF1)) och närbesläktade MAF-faktorer bidrar till att påverka den temperaturstyrda regleringen av blomningsprocessen i olika naturliga varianter av Arabidopsis thaliana.  För att utforska betydelsen av hur förändringar i temperaturen påverkar blomningsprocessen i Arabidopsis thaliana krävs en multiparallell strategi. Vi kommer att sortera cellkärnor via INTACT i kombination med andra generationens sekvensieringsmetoder för att undersöka hur temperaturförändringar påverkar regleringen av blomningsprocessen i naturliga varianter av Arabidopsis. Därefter kommer vi att använda ett modifierat CRISPR/Cas9-system som baserar sig på en katalytiskt inaktiv version av Cas9 (dCas9) för att målmedvetet manipulera transkriptions- och/eller kromatin/histon-faktorer lokaliserade på de loci som har identifierats via INTAC-experimenten som beskrivits ovan. Slutligen kommer CRISPR/Cas 9-systemet att användas för att undersöka FLM:ets funktioner då tidigare studier visat att FLM verkar ha en dubbel funktion då det kan reagera på förändringar av temperaturen på två olika sätt, dels genom en direkt temperatureffekt, dels genom att påverka närbesläktade MAF- gener och därmed blomningsprocessen.  

Anställningen avser heltid i två år med tillträde 1 oktober 2015 eller enligt överenskommelse.

Arbetsuppgifter

I arbetsuppgifterna ingår att etablera och analysera INTACT-reporterlinjer för att isolera cellkärnor från apikala skottmeristemet (SAM) i olika naturliga varianter av Arabidopsis thaliana som, baserat på hur de reagerar på temperaturförändringar, skiljer sig från de typiska labbvarianterna Col-0 och Ler. CRISPR/Cas9 -systemet att användas för att skapa olika deletionsmutanter av FLM-lokuset för att undersöka de olika specifika FLM-splice-varianternas roll för blomningsprocessen. Inledningsvis kommer experiment på FLM att utföras på Col-0, men senare kommer experiment att utföras på varianter med modifierade temperaturberoende blomningstidsprocesser. Slutligen kommer CRISPR/Cas9 att användas för att studera det komplexa genklustret MAF som befinner sig på Chr 5 hos Arabidopsis thaliana. Här ingår även försök till att producera högre ordningens MAF-mutantkombinationer med hjälp av CRISPR/Cas9-systemet, vilket hittills varit omöjligt att producera på grund av den genetiska länken mellan de individuella MAF-generna.

Kompetenskrav

Du har en doktorsexamen i populations- eller kvantitativ genetik eller motsvarande och djupa kunskaper om ettåriga växter för att självständigt kunna utföra försök på naturliga variationer av växter enligt projektbeskrivningen. Du ska också ha god erfarenhet av olika molekylärbiologiska metoder, såsom qRT-PCR, molekylär klonering, växttransformation, etc., samt ha goda skriftliga och muntliga kunskaper i engelska. Vidare värdesätts sociala och kreativa egenskaper samt självständigt initiativtagande.

Ansökan

Till ansökan skall bifogas: (1) en meritförteckning (Curriculum Vitae), med komplett publikationslista, och kopior av relevanta betyg och intyg, (2) en förteckning över vetenskapliga erfarenheter, (3) ett yttrande om vetenskapliga intressen, samt (4) namn och kontaktuppgifter till två referenspersoner.


Umeå Plant Science Center (UPSC) är ett internationellt erkänt centrum inom området experimentell växtbiologi. Centret består av två institutioner, en vid Umeå universitet och den andra vid Sveriges lantbruksuniversitet. Totalt arbetar nära 200 personer vid UPSC inom ca 40 forskargrupper. Närmare information om den verksamhet som bedrivs vid centret framgår av vår hemsida www.upsc.se



Umeå universitet vill erbjuda en miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vid varje rekrytering strävar vi efter ökad mångfald och använder möjligheten till positiv särbehandling.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.