Medarbetare inom bioinformatik ref.nr FOI-2017-568

FOI, Totalförsvarets forskningsinstitut, är ett av Europas främsta institut för tillämpad forskning inom försvar och säkerhet. FOI är en myndighet under Försvarsdepartementet och vi har till uppgift att bedriva forskning, metod- och teknikutveckling samt utredningsarbete för totalförsvaret och till stöd för nedrustning, icke-spridning och internationell säkerhet. Verksamheten bedrivs på uppdrag av i första hand Regeringskansliet, Försvarsmakten, Försvarets materielverk (FMV) och Myndigheten för samhällsskydd och beredskap (MSB). På FOI är vi ca 930 anställda varav ca 770 arbetar direkt med forskning och utveckling. Våra kompetenser spänner över hela fältet från naturvetenskap och teknik till samhälls- och statsvetenskap.

FOI söker dig med universitetsutbildning inom biologi, datavetenskap, eller bioinformatik och en djupgående förståelse för de sekvenserings- och analysmetoder som används för studier av biologiska system. Du ska även ha dokumenterad, grundläggande kunskap i statistik och programmering med skriptspråk, företrädesvis vana med R, Python och andra relevanta språk. Meriterande är en grundläggande kunskap i Unix/Bash/SQL, verktyg för att skapa bioinformatiska pipelines (Snakemake/Bpipe/Nextflow) samt erfarenhet av hantering av stora datamängder som genereras av moderna sekvenseringstekniker. Vid avdelningen bedrivs forskning och utveckling av direkta metoder för identifiering av högpatogena mikroorganismer i miljprover. I arbetsuppgifterna ingår att utveckla amplikonbaserad samt shotgunbaserad metagenomanalys i komplexa prover. Dessutom ingår utveckling av sekvensbaserad högupplösande typningsmetodik för både bakterier och virus. Arbetet drivs i projektgrupp som integrerar forskning inom områdena mikrobiell forensik, metagenomik och mikrobiell populationsgenetik. Vi söker nu en person för arbete som syftar till att utveckla nya metoder inom dessa områden baserat på den senaste generationen RNA- och DNA-sekvenseringstekniker. I arbetet ingår bioinformatisk bearbetning, analys och tolkning av DNA- och RNA-metagenomdata samt utveckling av analysmetoder för Oxford Nanoporesekvenseringsdata. Möjlighet att medverka till publicering av vetenskapliga artiklar finns.

Vi fäster stor vikt vid personliga egenskaper som självständighet, flexibilitet, initiativrikedom och god samarbetsförmåga. Du ska ha lätt för att uttrycka Dig i tal och skrift såväl på svenska som på engelska.

Tjänsten är en tillsvidareanställning på heltid, lokaliserad i Umeå, som inleds med sex månaders provanställning.

Kunskap om farliga kemikalier, radioaktivt material, joniserande strålning, farlig smitta och kärnvapenrelaterade frågor är mycket angeläget såväl för försvaret som för det civila samhället. På FOI:s avdelning för CBRN-skydd och säkerhet finns samhällets främsta experter på kemiska, biologiska, radioaktiva och nukleära händelser.



Vi erbjuder

På FOI drivs vi av att få bidra till samhällsnyttan genom att bedriva forskning inom försvar och säkerhet för våra uppdragsgivare. Här finns en inspirerande och kreativ miljö fylld av kompetens, nyfikenhet, mod och nytänkande. Hos oss ges du möjlighet till kontinuerlig personlig kompetensutveckling som anpassas så att både du som person och vi som organisation kan växa tillsammans.

FOI strävar efter mångfald där medarbetarnas bakgrund, erfarenheter, kunskaper och personlighet berikar verksamheten. Vi arbetar medvetet för att vår arbetsplats ska ha en god arbetsmiljö och vara jämställd. Vi underlättar för våra medarbetare och chefer att kombinera arbetet med föräldraskap.

Har vi fångat ditt intresse?

Om du har frågor är du välkommen att ringa eller skriva till kompetensområdesledare Mats Forsman ( mats.forsman@foi.se ) Fackliga företrädare är Johanna Qvarnström (SACO) och Petrus Hemström (OFR/S – ST vid FOI). Samtliga nås på telefon 08-555 030 00.

Då anställningen är placerad i säkerhetsklass krävs svenskt medborgarskap. Säkerhetsprövning med registerkontroll kommer att genomföras före anställning enligt 19 § i säkerhetsskyddslagen.

Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast 2017-05-10 . Vi vill att du fyller i de utbildningar och erfarenheter som är relevanta för jobbet. I slutet av ansökningsformuläret kan du sedan bifoga ett komplett CV och ett personligt brev.