Postdoktor

Välkommen till Linnéuniversitetet. En plats för kunskap, idéer och utveckling. För växtkraft och framtidstro. I Småland, i världen.Anställning som Postdoktor 2 år (100 %), anställningen får förlängas vid särskilda skäl.

Projektet

Anställningen är knuten till forskningsprogrammet BLUEPRINT, en del av ramprogrammet BONUS som gemensamt finansieras av EU och Östersjöländerna. Målsättningen med BLUEPRINT är att utveckla indikatorer som kan kopplas till miljöstatus i Östersjön baserade på genetisk information från metagenom från lokala vattenprover. I den del av programmet som den annonserade anställningen är kopplad till kommer en viktig del av arbetet att t.ex. bestå av att bearbeta metagenomdata från varierande förhållanden i Östersjöns miljö.  Den bioinformatiska utmaningen är att omvandla den genetiska informationen, i form av antal specifika gener som identifieras eller dessa geners relativa uttryck, till en matris som kan fånga detaljerna i ett givet metagenom/metatranskriptom från ett naturligt prov. Datamatrisen skall dels användas för att beräkna värden eller intervall för en eller flera ”Biochemical Pathway Indicator” (BPI ), dels att ur samma metagenom matris generera indata för att avgränsa och utveckla biogeokemiska modeller för Östersjön. För modellering och animering av resultaten krävs att de metaboliska vägarna kan demonstreras på en karta. Denna bör vara så utformad att gener som är kopplade till särskild geokemi framhävs. Uppgifter för den biogeokemiska modellens formulering kan också vara att hitta ett sätt att representera elektron -och energiflöden som motsvarar en genomsnittlig tillväxttakt hos funktionella mikrobiella grupper.

Den sökande skall ha en gedigen bakgrund i mikrobiologi och bioteknologi med en PhD i något av dessa ämnen. Examen skall ha avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång. Viktigt för anställningen är erfarenhet av mikrobiell ekologi och evolutionära processer samt omfattande erfarenhet av bioinformatik, programmering och metagenomik. Dokumenterad erfarenhet av analyser i komparativ genomik och fylogeni samt utnyttjandet av redskap för annotering av genomdata är särskilt meriterande.

Vid frågor, vänligen kontakta Åke Hagström tel 076-6186460, Jarone Pinhassi tel 0480-44 62 12.Personalkonsult Ulrika Petersson, tel 0480-446996.

Fackliga företrädare nås via universitetets växel, tel 0772-28 80 00.

Välkommen med din ansökan som du registrerar via knappen ansök nedan till höger. Ansökan ska vara registrerad senast 22 maj 2014. Ansökningshandlingarna skall innehålla ett CV inklusive publikationslista samt personligt brev med motivering till varför du söker anställningen. Ref: PA 2014/231-2.2.1

 
Registrera din ansökan via knappen "Ansök" längst ned i annonsen. De meriter Du åberopar ska Du styrka med intyg och de ska bifogas digitalt i din ansökan. Ansökan och övriga handlingar ska märkas med anställningens diarienummer. Alla handlingar som åberopas ska vara inkomna till universitetet senast kl. 24.00 sista ansökningsdagen.