Postdoktor (2 år) i datadriven livsvetenskap

Medicinska fakulteten är platsen för forskning och utbildning inom vetenskapsområdet medicin. Här finns 12 grundutbildningsprogram, 13 institutioner och ett 80-tal ämnesinriktningar inom forskarutbildningen.



Integrated Science Lab (IceLab) tillsammans med institutionerna för datavetenskap, fysik och radiofysik, samtliga dynamiska och internationellt framgångsrika miljöer vid Umeå universitet, söker två postdoktorer, en för vart och ett av följande två tvärvetenskapliga projekt: (1) Anonymisering av data inom precisionsmedicinsk forskning och (2) Snabb interaktiv visualisering med låg distorsion av precisionsmedicindata.

Positionerna är en del av ett samarbete mellan de två största forskningsprogrammen i Sverige, Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, (WASP) samt SciLifeLabs och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (Data-Driven Life Science, DDLS). Målet är att lösa banbrytande tvärdisciplinära forskningsfrågor.

Projektbeskrivning – Anonymisering av data inom precisionsmedicinsk forskning
För att främja biobanksanvändning och precisionsmedicinsk forskning har medicinska fakulteten vid Umeå universitet lanserat PREDICT, ett brett övergripande infrastrukturprojekt för att förstå sjukdomsförlopp, identifiera biomarkörer för tidig upptäckt av sjukdom och för att undersöka samsjukligheter. PREDICT är en precisionsmedicinplattform med etiskt godkännande för att hjälpa biobanksgivare med ett förnyat, modernt informerat samtycke för att koppla biobanksdata till journaler. Projektet kommer att gynna PREDICTs mål att bidra till förbättrad hälsa i vår befolkning.

Data som genereras från humana biobanksprover och journaler är känsliga personuppgifter. Hanteringen av känsliga personuppgifter regleras av den allmänna dataskyddsförordningen (GDPR), vilket gör det svårt att dela och återvinna biobanksdata. För optimal användning av biobanksdata syftar detta projekt till att utveckla maskininlärningsmetoder för dataanonymisering och utvärdering av anonymiserade biomedicinska data baserat på datakvalitet och risk för återidentifiering, vilket möjliggör datadelning och återvinning utan begränsningar av GDPR.

Kvalifikationer
För att anställas med stöd av postdoktoravtalet krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.

En förutsättning för att bli anställd som postdoktor är att forskaren inte tidigare har varit anställd som postdoktor under mer än ett år i samma eller näraliggande ämnesområde vid Umeå universitet. För att anställas med stöd av postdoktoravtalet bör främst den komma i fråga som har avlagt examen enligt föregående stycke för högst tre år sedan. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/ uppdrag. Postdoktor som ska undervisa eller handleda ska ha relevant högskolepedagogisk utbildning.

Vi söker en motiverad och ansvarstagande kandidat som brinner för att utvecklas som en självständig forskare och gruppmedlem.

· Bakgrund inom datavetenskap, fysik eller ett relaterat tekniskt område.
· Programmeringskunskaper i minst ett språk som Go, Rust, Python, R eller Matlab.
· Forskning och praktiska erfarenheter inom datavetenskap, maskininlärning eller relevanta     discipliner med verktyg som PyTorch eller Tensorflow.
· Erfarenhet av integritetsskydd eller medicinsk dataanalys är meriterande.

Goda kunskaper i talad och skriven engelska är ett krav. Kandidaten ska ha ett starkt intresse för tvärvetenskaplig forskning, vara mycket motiverad och ha förmåga att arbeta självständigt och som en del av forskargruppen. Personliga egenskaper som samarbets-, kommunikations- och analytiska förmågor är viktiga.

Om anställningen
Innehavaren av tjänsten kommer att arbeta tillsammans i IceLab med en tvillingpostdok som kommer att arbeta med snabb interaktiv visualisering med låg distorsion av precisionsmedicindata.

Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till två år med tillträde i maj 2022 (exakt startdatum enligt överenskommelse). 

Ansökan
Ansökan ska innehålla:
· Ett följebrev med kort beskrivning av dina kvalifikationer, forskningsintressen och motivering varför du söker (max 2 sidor), 
· En meritförteckning (CV),
· En publikationslista,
· Styrkta kopior på relevanta examensbevis, eller, om examensbevis inte har utfärdats ännu, intyg     om godkänd avhandling, godkända fullständiga doktorandkurser eller datumet för din planerade  avhandling,
· Kontaktuppgifter till två referenspersoner (namn, organisation, titel, relation till sökanden,
 e-post,  telefonnummer) 

Ansökan ska skrivas på svenska eller engelska. Ansökan ska göras i vårt e-rekryteringssystem Varbi senast den 15 april 2022.

Information
I IceLab främjar och underlättar vi transdisciplinära samarbeten – med fokus på spetsforskning som integrerar teoretiskt, beräkningsmässigt och empiriskt arbete. Vi kombinerar matematisk och beräkningsmodelleringsexpertis med ett stort intresse för att arbeta med empiriska forskare. Mer information på https://icelab.se 

För mer information om anställningen, kontakta Beatrice Melin, beatrice.melin@umu.se  eller Martin Rosvall martin.rosvall@umu.se  

Välkommen med din ansökan!