Postdoktor (2 år) i datadriven livsvetenskap

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi.


Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur där vi gläds åt varandras framgångar. Är du intresserad av att veta mer om Umeå universitet som arbetsplats läs mer https://www.umu.se/jobba-hos-oss/




Integrated Science Lab (IceLab) tillsammans med institutionerna för datavetenskap, fysik och radiofysik, samtliga dynamiska och internationellt framgångsrika miljöer vid Umeå universitet, söker en postdoktor till det tvärvetenskapliga projektet) Snabb interaktiv visualisering med låg distorsion av precisionsmedicindata.

Anställningen är en del av ett samarbete mellan de två största forskningsprogrammen i Sverige, Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, (WASP) samt SciLifeLabs och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (Data-Driven Life Science, DDLS). Målet är att lösa banbrytande tvärdisciplinära forskningsfrågor.

Projektbeskrivning
För att främja biobanksanvändning och precisionsmedicinsk forskning har medicinska fakulteten vid Umeå universitet lanserat PREDICT, ett brett övergripande infrastrukturprojekt för att förstå sjukdomsförlopp, identifiera biomarkörer för tidig upptäckt av sjukdom och för att undersöka samsjukligheter. PREDICT är en precisionsmedicinplattform med etiskt godkännande för att hjälpa biobanksgivare med ett förnyat, modernt informerat samtycke för att koppla biobanksdata till journaler. Projektet kommer att gynna PREDICTs mål att bidra till förbättrad hälsa i vår befolkning.

Data som genereras från humana biobanksprover och journaler är känsliga personuppgifter. Hanteringen av känsliga personuppgifter regleras av den allmänna dataskyddsförordningen (GDPR), vilket gör det svårt att dela och återvinna biobanksdata. För optimal användning av biobanksdata syftar detta projekt till att utveckla maskininlärningsmetoder för dataanonymisering och utvärdering av anonymiserade biomedicinska data baserat på datakvalitet och risk för återidentifiering, vilket möjliggör datadelning och återvinning utan begränsningar av GDPR.

Kvalifikationer
För att anställas med stöd av postdoktoravtalet krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.

För att anställas med stöd av postdoktoravtalet bör främst den komma i fråga som har avlagt examen enligt föregående stycke för högst tre år sedan. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/ uppdrag. Postdoktor som ska undervisa eller handleda ska ha relevant högskolepedagogisk utbildning.

Vi söker en motiverad och ansvarstagande kandidat som brinner för att utvecklas som en självständig forskare och gruppmedlem. Den sökande ska ha:
·        Bakgrund inom datavetenskap, fysik eller ett relaterat tekniskt område.
·        Programmeringskunskaper i minst ett språk som Go, Rust, Python, R eller Matlab.
·        Forskning och praktiska erfarenheter inom datavetenskap, maskininlärning eller relevanta discipliner med verktyg som PyTorch eller Tensorflow.
·        Erfarenhet av moderna webbspråk som Javascript, HTML5 och CSS3.

Goda kunskaper i talad och skriven engelska är ett krav. Kandidaten ska ha dokumenterad erfarenhet av tvärvetenskaplig forskning, vara mycket motiverad och ha förmåga att arbeta självständigt och som en del av forskargruppen. Personliga egenskaper som samarbets-, kommunikations- och analytiska förmågor är viktiga. En förutsättning för att bli anställd som postdoktor är att forskaren inte tidigare har varit anställd som postdoktor under mer än ett år i samma eller näraliggande ämnesområde vid Umeå universitet.

Om anställningen
Innehavaren av tjänsten kommer att arbeta tillsammans i IceLab med en tvillingpostdok som kommer att arbeta med anonymisering av precisionsmedicinsdata.

Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till två år med tillträde i januari 2023 (exakt startdatum enligt överenskommelse). 

Ansökan
Ansökan ska innehålla:

- Ett följebrev med kort beskrivning av dina kvalifikationer, forskningsintressen och motivering varför du söker (max 2 sidor),
- En meritförteckning (CV),
- En publikationslista,
- Styrkta kopior på relevanta examensbevis, eller, om examensbevis inte har utfärdats ännu, intyg om godkänd avhandling, godkända fullständiga doktorandkurser eller datumet för din planerade disputation,
- Kontaktuppgifter till två referenspersoner (namn, organisation, titel, relation till sökanden, e-post, telefonnummer)

Ansökan ska skrivas på svenska eller engelska. Ansökan ska göras i vårt e-rekryteringssystem Varbi senast den 23 december 2022.

Information
I IceLab främjar och underlättar vi transdisciplinära samarbeten – med fokus på spetsforskning som integrerar teoretiskt, beräkningsmässigt och empiriskt arbete. Vi kombinerar matematisk och beräkningsmodelleringsexpertis med ett stort intresse för att arbeta med empiriska forskare. Mer information på https://icelab.se 

För mer information om anställningen, kontakta Beatrice Melin, mailto:beatrice.melin@umu.se  eller Martin Rosvall mailto:martin.rosvall@umu.se  

Välkommen med din ansökan!

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.


Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.