Postdoktor

Institutionen bildades i slutet av 70-talet när Skogshögskolan flyttade till Umeå. Antalet medarbetare har sedan dess stadigt ökat och uppgår idag till ett 100-tal, postdoktorer, gästforskare och doktorander inräknade. I slutet av 90-talet väcktes idén att bilda ett forsknings- och utbildningscenter i experimentell växtbiologi, Umeå Plant Science Centre (UPSC), tillsammans med institutionen för fysiologisk botanik vid Umeå universitet. Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi flyttade då in i lokaler i direkt anslutning till sin samarbetspartner, och de två institutionerna har numera ett mycket nära och framgångsrikt samarbete inom forskning och utbildning. Det internationella inslaget vid UPSC är stort med över 40 nationaliteter representerade.

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi bedriver forskning och utbildning i växtfysiologi, ekofysiologi, växtmolekylärbiologi, skogsgenetik och skogsbioteknik inom ramen för SLU's jägmästarprogram och på mastersnivå. Institutionen erbjuder även forskarutbildning inom dessa områden.
Mer information om Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi och UPSC hittar du på www.upsc.se.

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi
Kolinlagring och kolcykling i boreala skogar regleras av komplexa interaktioner mellan träd och markens mikroorganismer. Det har skett
stora framsteg inom DNA-sekvensering, som har gjort det möjligt att få en inblick i dessa komplexa mikrobiella samhällen, men
befintliga metoder begränsar vår förmåga att förutsäga hur förändringar i miljöförhållandena kommer att påverka dessa associationer och
det viktiga ekosystemtjänster som de tillhandahåller. Vi har nyligen utvecklat en metatranskriptomisk analytisk pipeline för prover som
samlats in från mogen granskog som fångar upp de säsongsmässigt upplösta transkriptomerna av granrötter och mer än 350
rotassocierade svamparter (https://doi.org/10.1073/pnas.2118852119). Detta tillvägagångssätt har gjort det möjligt för oss att koppla
värdträdets funktionella svar på förändrad näringstillgång till djupgående störningar i svampsamhället. Vårt mål är att tillämpa denna
metodik på fler skogstyper och miljöer för att utveckla en mer fullständig förståelse för hur dessa skogar och deras mikrobiota kan
anpassa sig till framtida klimatförhållanden.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Arbetsuppgifter:
Planera och utföra transkriptomanalys av RNA-seq data insamlad från tall och gran, och kopplad metatranscriptomics-analys av den länkade svampgemenskapen, följt av sammanställning av genererad data i vetenskapliga manuskript.

Kvalifikationer:
Kandidaten behöver vara högst motiverad och vara en stark lagspelare. För att kvalificera för tjänsten skall sökanden inneha en doktorsgrad (PhD) inom ett för tjänsten relevant fält, såsom växters molekylärgenetik eller växtbiokemi. Sökanden behöver kunna visa prov på kunskap och expertis med avseende på abiotiska stress-responser hos växter, samt växters tillväxtprocesser. Dokumenterade färdigheter inom bioinformatik är nödvändiga och sökanden bör ha erfarenhet av analys av next generation sequencing-data, körning av analyser på specialiserad datorinfrastruktur, tolkning av resultat av differentialla uttrycksanalyser och ha bevisad erfarenhet av att driva projekt från start till vetenskaplig publikation.  Utöver detta är tidigare erfarenhet med för projektet relevanta offentliga databaser för genomik och molekylärbiologi, samt god kunskap inom statistik t.ex. hypotestestning och berikningsanalys till sökandens fördel.  Ingående kunskap om, och färdigheter av, åtminstone ett relevant programmerings- och/eller scriptspråk, t.ex. R, Java eller Python är nödvändiga. Erfarenhet av datormodellering av co-expression nätverk och ontologier (särskilt gen-ontologier), kunskap om annotering av biologiska funktionsvägar och maskin-lärning för analys av transkriptomdata är nödvändigt för att lyckas i rollen. Rollen kräver även utmärkta kunskaper (såväl skriftliga som muntliga) i engelska språket.

Anställningen vänder sig främst till juniora forskare och den sökandes doktorsexamen får vara högst tre år vid anställningsbeslutet.

Placering:
Umeå

Anställningsform:
Tidsbegränsad anställning 24 månader, med möjlighet till förlängning.

Omfattning:
100%

Tillträde:
2023-09-04 eller enligt överenskommelse.

Ansökan:
Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast den 2023-07-31.

Fackliga kontaktpersoner:
https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/



Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen för hållbart liv, grundad i vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspelen mellan människa, djur och ekosystem och ett ansvarsfullt brukande av naturresurserna bidrar vi till en hållbar samhällsutveckling och goda livsvillkor på vår planet. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet.

SLU har drygt 3000 medarbetare, 5000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över tre miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden. Vi arbetar för en jämställd och inkluderande arbetsmiljö där öppna samtal mellan människor med olika erfarenheter lägger grunden för vetenskaplighet, kreativitet och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och perspektiv att söka den aktuella anställningen.