Postdoktor i Bioinformatik för växtförädling och optimering av genetiska re

Postdoktor i Bioinformatik för växtförädling och optimering av genetiska re Tjänsten är finansierad av SLU:s Växtförädlingsplattform Sedan 1 juli 2014 finns en växtförädlingsplattform vid SLU. Dess uppgift är att främja en intern samordning av SLU:s resurser och insatser inom växtförädling för jordbruk, skogsbruk och trädgårdsodling och inkluderar forskning, grundutbildning, infrastruktur och outreach. Den verkar också för att stärka SLU:s profil i växtförädling i förhållande till omvärlden. Växtförädling är en disciplin som finns i flera av SLU:s institutioner och fakulteter och måste samordnas mellan olika platser och fakultetsgränser. Växtförädlingsplattformen inkluderar fakulteten för landskapsarkitektur, trädgårds- och växtproduktionsvetenskap, fakulteten för skogsvetenskap samt fakulteten för naturresurser och jordbruksvetenskap. En kommitté med två medlemmar från varje fakultet leder samordningsarbetet. Särskilda medel har avsatts för denna satsning. Varje fakultet kommer från 1 juli 2015 att ha huvudmentorskap för en tvåårig postdoktortjänst finansierad av plattformen. De tre postdoktorprojekten har en tydlig övergripande fakultetsprofil med handledare vid olika fakulteter och med resurser för att främja SLU:s samarbete över campus- och fakultetsgränser.


För fullständig annons se: www.slu.se/lediga-tjanster
Arbetsuppgifter: Växter producerar tusentals föreningar och en viktig uppgift blir att försöka koppla sekvensinformation och proteiner i regleringen av primärproduktion och signalering som en reaktion på miljön. Fokus kommer att ligga på stressuthålligheten hos potatis mot oomyceter och virus. Postdoktortjänsten handlar även om att utföra jämförande transkriptomanalys på grödan quinoa och analysera sorter med kontrasterande protein-kvantitet och -kvalitet, samt på havrekärnans vävnader från havregenotyper med olika oljehalt. Tjänsten är placerad vid SLU:s campus i Alnarp med samverkan med växtforskare och andra bioinformatiker även vid andra SLU campus. Personen kommer även kopplas till forskningsnätverket PlantLink (www.plantlink.se), ett samarbete mellan SLU Alnarp och Lunds universitet.

Kvalifikationer: Doktorsexamen är ett krav för postdoktoranställningen. Vi söker en person som har erfarenhet av beräkningsbiologi och helst en bakgrund inom växtmolekylärbiologi eller genetik. Den sökande ska vara bekant med några av följande ämnesområden: funktionell annotering, dataintegrering, Next-generation sequencing (NGS), proteomik och metabolomik. Kunskaper i hantering av stora datamängder, programmeringsspråk (t.ex. Perl, Python, R) och statistiska metoder är ett krav. Dokumenterad erfarenhet av databashantering och Unix systemadministration är positivt. Den sökande ska ha utmärkt kommunikationsförmåga.