Postdoktor i genomisk prediktion och associationsgenetik

Institutionen för växtförädling, SLU, Alnarp

Institutionen för växtförädling undervisar och utför strategisk och tillämpad forskning på hortikulturella grödor och jordbruksgrödor med målet att tillhandahålla kunskap, verktyg och produkter för en biobaserad ekonomi, en hållbar miljö och en förbättrad hälsa hos människor. Inom avdelningen för växtförädling använder vi ett brett spektrum av tekniker; från fältexperiment och karakterisering av jordbrukets biologiska mångfald, till genetik, genomik, genteknik, biokemi och fysiologi. Mer info angående institutionen finns här. 

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Projektet

Kadmium (Cd) är en tungmetall som förekommer naturligt i miljön och som lätt tas upp av växternas rötter. Hög Cd -koncentration i växter har en negativ inverkan på både växters tillväxt och människors hälsa. Huvudmålet med detta projekt, som finansieras av SLU Grogrund, är att identifiera höstvete och havregenotyper som visar låga halter av kadmium i kärnan oberoende av Cd -marknivåer och utveckla prediktionsmodeller och diagnostiska markörer som kan användas i förädlingsprogram samt den officiella VCU-testningen. Projektet kommer att genomföras i samarbete med institutionen för växtförädling, institutionen för mark och miljö, institutionen för växtproduktionsekologi och Lantmännen AB. Arbetet kommer periodvis innebära resor mellan de medverkande organisationerna och fältförsöken.

Arbetsuppgifter:
Postdoktorn kommer att fenotypa höstvete och havregenotyper i fältet för agronomiska egenskaper, utföra statistiska analyser, analysera Cd-koncentration i höstvete och havrekärnor, utföra associationsstudier och utveckla en genomisk prediktionsmodell för genotyper med stabilt låga kadmiumnivåer i kärnan. Kandidaten kommer att hjälpa till att sprida och publicera resultaten för såväl allmänheten som vetenskaplig publik på både nationell och internationell nivå och i fackgranskade tidskrifter. Dessutom kommer den framgångsrika kandidaten att bistå med att handleda BSc- och MSc- studenter och doktorander.

Kvalifikationer:
Anställningen är avsedd för en junior forskare och vi söker främst personer som avlagt doktorsexamen för högst tre år sedan


• Doktorsexamen i avel/genetik
• Utmärkt engelska i tal och skrift
• God kunskap om teoretisk och tillämpad kvantitativ genetik
• Expertkunskaper i genomisk prediktionsmodellering
• Stark kommandorad-och kodning/programmeringskunskaper (t.ex. R, Python, Linux -system) samt erfarenhet av programvara för bearbetning och analyser av stora genomiska uppsättningar
• Förmåga att arbeta i ett team såväl som att självständigt organisera och prioritera sitt arbete
• Dokumenterad erfarenhet av att skriva och publicera i vetenskapligt granskade tidskrifter

Meriterande


• Erfarenhet av GWAS
• Kunskap och erfarenhet av fenotypning av grödor under fältförhållanden
• Erfarenhet av laborativt arbetet

Placering:
Alnarp

Anställningsform:
Tidsbegränsad anställning 24 månader, med möjlighet till förlängning.

Omfattning:
100%

Tillträde:
Februari 2023 eller enligt överenskommelse.

Ansökan:
Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast den 2023-01-09.

Fackliga kontaktpersoner:
https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/



Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) är ett universitet i internationell toppklass med forskning, utbildning och miljöanalys inom vetenskaper för hållbart liv. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. Hos oss samlas människor med olika perspektiv men med det gemensamma målet att skapa de bästa förutsättningarna för en hållbar, levande och bättre värld.

SLU har drygt 3000 medarbetare, 5000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över tre miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden.

www.slu.se