Postdoktor i maskininlärning med tillämpningar inom epidemiologi

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns cirka 44 000 studenter och mer än 8 000 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet.




Enheten för beräkningsbiologi och biologisk fysik bedriver forskning inom beräkningsbiologi och maskininlärning utnyttjande ett brett spektrum av modeller och metoder som ofta har rötter inom statistisk och beräkningsfysik.

Särskilt utvecklar enheten tekniker inom maskininlärning för tillämpningar inom biomedicin och hälso- och sjukvård, beräkningsmetoder för biomolekylära och cellulära system, samt metoder för analys av spektroskopiska data samt bildbehandling för biologiska processer.

Forskningen är genuint tvärvetenskaplig till sin karaktär och bedrivs ofta i samarbete med grupper från andra discipliner.

Enheten för beräkningsbiologi och biologisk fysik utannonserar nu en anställning som postdoktor på två år inom maskininlärning med tonvikt på epidemiologiska tillämpningar med start i april 2022, eller enligt överenskommelse.

Introduktion
Gruppen för beräkningsbiologi och biologisk fysik är engagerad i ett antal tvärvetenskapliga projekt där maskininlärningsmetoder utvecklas för tillämpningar inom hälso- och sjukvården. Postdoktorn kommer att vara involverad i projekt där maskininlärningsmetoder tillämpas på hälso- och sjukvårdsdata för att öka kvaliteten och effektiviteten i vården. Fokus kommer att ligga på kardiometabola sjukdomar, såsom tidig identifiering och prevention, samt förbättrad diagnostik bland patienter som söker akutvård. Utvecklade modeller och verktyg kommer att bygga på maskininlärning med omfattande hälso- och sjukvårdsdata, inklusive elektrokardiogram, från elektroniska journaler och olika sjukvårdsregister. Projektet är tvärvetenskapligt och omfattar partners från andra fakulteter samt vårdgivare.

Arbetsuppgifter
Postdoktorn kommer att arbeta med maskininlärning, delvis baserade på deep learning, för diagnostiska och prediktiva syften. Arbetet inkluderar arbete med heterogena databaser och förbehandling av medicinska data. Projektet är i grunden tvärvetenskapligt och postdoktorn kommer att ha regelbundna kontakter med expertis inom andra områden som akutmedicin, IT, epidemiologi, statistik och språkteknik.

Anställningen kommer att innehålla möjligheter till undervisning och handledning motsvarande högst 20 % av heltid. Inom ramen för anställningen ges möjlighet till tre veckors högskolepedagogisk utbildning.

De huvudsakliga arbetsuppgifterna är:

- att bedriva maskininlärningsforskning och utveckling av applikationer inom olika projekt
- att bidra till vetenskapliga publikationer och konferensbidrag (och ansvara för dessa när så är lämpligt)
- att bidra till rapportskrivning

Behörighet
Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom anställningens ämnesområde och som avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

Bedömningsgrunder
Detta är en meriteringsanställning inriktad på forskning. Anställningen är tänkt som ett inledande steg i karriären och bedömningen av de sökande kommer i första hand att baseras på deras vetenskapliga meriter och potential som forskare.

Sökanden ska ha avlagt en doktorsexamen i maskininlärning, tillämpad matematik, datavetenskap, beräkningsbiologi eller annat relevant område såsom epidemiologi kombinerat med tillräckliga kunskaper och färdigheter i tillämpade maskininlärningsmetoder. Den sökande måste visa en stark forskningsprofil inom de områden som är av intresse för denna anställning. Vetenskapliga resultat förväntas publiceras i fackgranskade forskningstidskrifter och konferenser med hög kvalitet. Den sökande ska dela värdegrunden av att mångfald och jämställdhet mellan forskare och lärare ger högre kvalitet i forskning och utbildning. 

Ytterligare behörighetskrav:

- goda kunskaper i engelska
- gedigen erfarenhet av programmering

Kunskaper och erfarenheter som anses vara meriterande:

- förmåga att bedriva oberoende forskning
- erfarenhet av maskininlärning för medicinska tillämpningar
- erfarenhet av att arbeta med heterogena hälso- och sjukvårdsdata, inklusive elektrokardiogram
- goda kunskaper i svenska 
- förmåga att attrahera extern finansiering
- erfarenhet av handledning av masterstudenter

Villkor
Anställningen är tidsbegränsad till högst 2 år. Anställningen tidsbegränsas enligt avtal, “Avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor”, mellan arbetsmarknadens parter daterat 2008-09-04 (Arbetsgivarverket, OFR:s, Saco-S och SEKO).

Ansökningsförfarande
Ansökan ska innehålla ett CV, ett personligt brev, en publikationslista och en kopia på doktorsdiplom, eller dokumentation som gör det troligt att en doktorsexamen kommer att erhållas före anställningens start.

Kontakt
Maskininlärning: Mattias Ohlsson, +46 46 2227782, mattias@thep.lu.se  
Akutmedicin: Ulf Ekelund, +46 46 176744, ulf.ekelund@med.lu.se
Epidemiologi: Jonas Björk, +46 46 2226916, jonas.bjork@med.lu.se

Vid Naturvetenskapliga fakulteten bedrivs forskning och utbildning inom biologi, astronomi, fysik, geovetenskap, kemi, matematik och miljövetenskap. Verksamheten bedrivs vid nio institutioner samlade inom norra universitetsområdet. Fakulteten har ca 1 500 studenter, 330 forskarstuderande och 700 anställda.

Institutionen för astronomi och teoretisk fysik bedriver forskning och undervisning inom tre huvudområden: astronomi och astrofysik; teoretisk partikelfysik; samt beräkningsbiologi och biologisk fysik. Vår forskning är nyfikenhetsdriven, grundad i strävan att förstå hur verkligheten är uppbyggd, från de minsta partiklarna till universum i stort, såväl som livet självt. Inom alla tre områden har vi en internationellt stark ställning och vi arbetar aktivt för att ytterligare stärka vårt internationella renommé.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.