Postdoktor i masspektrometri

Karolinska Institutet

Arbetsplats på ScLifeLab (Stockholm) och Centrum för Molekylär Medicin, KI

Beskrivning

Science for Life Laboratoriet (SciLifeLab, www.scilifelab.se) är ett nationellt resurscentrum för forskning inom molekylär biovetenskap och medicin och är en sammanslutning mellan Karolinska Institutet, Kungliga Tekniska högskolan, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Verksamheten startade 2010 med stöd från en regeringsstödd strategisk satsning som skapat tekniska plattformar för molekylär biovetenskaplig forskning i en kraftfull forskningsmiljö med en stark tvärvetenskaplig prägel. Plattformarna är inriktade på storskalig biologisk och medicinsk forskning med fokus på tekniskt avancerad datagenerering samt uppbyggnad av hög kompetens inom bioinformatik och systembiologi. Avdelningen för masspektrometri är utrustad med de senaste teknikerna för peptid-separation och masspektrometri (Orbitrap Velos, Q-Exactive Thermo, high resolution QTOF (Agilent), MALDI-TOF/TOF and tripleQ (Agilent). Vår Pediatriska reumatologiska forskningsgrupp (cmm.ki.se/en/Research/Inflammatory-Diseases/Rheumatology-Unit/Innate-Inflammation), ledd av prof Ulf Andersson, samarbetar med dr Janne Lehtiös forskningsgrupp på SciLifeLab (Stockholm) för att utveckla proteomik metoder för kliniska tillämpningar.

Centrum för Molekylär Medicin (CMM, cmm.ki.se) vid Karolinska Universitetssjukhuset/Karolinska Institutet är ett forskningscentrum med fokus på kroniska inflammatoriska folksjukdomar. Vår Pediatriska reumatologiska forskningsgrupp är placerad vid CMM:s Reumatologiska forskningslaboratorium, som bedriver translationell forskning kring inflammatoriska processer i autoimmuna sjukdomar. Det specifika syftet för våra studier är att utforska basala biologiska funktioner hos den endogena, proinflammatoriska mediatorn HMGB1 – den prototypiska alarmin molekylen. Vi tillämpar vårt molekylära kunnande i diagnostiskt, prognostiskt och terapeutiskt syfte. De biologiska funktionerna av HMGB1 isotypformer regleras av väldefinierade post-translationella modifieringar av molekylen.

Arbetsuppgifter

En postdoktortjänst är nu tillgänglig för en mycket motiverad och kvalificerad postdoktor med bakgrund inom massspektrometri (MRM/SRM). Projektet syftar till utveckling och tillämpning av befintliga LC-MS/MS analys metoder för identifiering av post-translationella av modifikationer av HMGB1 . Det biologiska och kliniska fokuset faller inom forskningsfältet för inflammation.

Kvalifikationer

För behörighet krävs doktorsexamen eller motsvarande utländsk examen avlagd de senaste sju åren, företrädesvis i analytisk kemi, biokemi eller likartat relevant ämne. Sökanden som ännu inte har disputerat är behöriga att söka om disputation planeras inom tre månader efter sista ansökningsdatum. Ett intyg från disputationskommitté eller motsvarande måste då bifogas ansökan. Kunnighet i forskningsarbete med masspektrometri och proteinkemi/rening med hjälp av nanokromatografi och peptid masspektrometri är en förutsättning. Erfarenhet av kvantitativt proteomicsarbete och targeted masspektrometri är likaså nödvändigt. Sökande måste också ha basala kunskaper i statistik och av användande av olika MS-analysprogram. Flytande engelska är ett krav.



Anställningsform

Heltidstjänstgöring från 2013-10-15 till 2014-12-31 med möjlighet till förlängning.