Postdoktor i metagenomiska och jämförande genomiska studier

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 7 000 anställda och en omsättning på 6,5 miljarder kronor.



En tvåårig postdoktoranställning (tillträde snarast möjligt) är tillgänglig i Dr.

Anja Spangs forskargrupp som är baserad vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Uppsala Universitet. Positionen, som finansieras av ett VR Etableringsbidrag (till Anja Spang), erbjuds för en tvåårsperiod. Postdoktorn kommer att vara vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Uppsala Universitet, och integrerat i forskningsgruppen av Universitetslektor Professor Thijs Ettema (se http://www.ettemalab.org/).

Dr. Spang har ett starkt intresse i den roll som symbios har haft i livets utveckling på Jorden (som till exempel i ursprunget till den komplexa eukaryota cellen) och betydelsen som symbiotiska interaktioner idag har för evolutionen av arkéer. Därför ligger ett särskilt fokus på hennes nuvarande forskning i studierna av utvecklingen, cellbiologin, ekologin och den fylogenetiska mångfalden av DPANN arkéer, som består av organismer med extremt små genom och cellstorlekar.

Metagenomiska och komparativa fylogenomiska metoder har visat sig mycket användbart för att rekonstruera genom av den okända mikrobiella majoriteten, och för att analysera deras metaboliska potential och deras evolution. Avancerade bioinformatiska metoder blir alltmer nödvändiga för att adekvat analysera den stora mängd av sekvensdata, som har genererats nyligen.

Arbetsuppgifter: Projektet fokuserar på utveckling och användning av nya metagenomiska verktyg, vilket inkluderar sofistikerade ”binning” metoder, som gör det möjligt att få mycket kompletta, icke-redundanta genom av djupt rotade arkéer. Dessutom kommer det att användas och vidareutvecklas, sofistikerade fylogenomiska och komparativa metoder, för att modellera genomevolution (och reduktion) i arkéer.

Kvalifikationskrav: Den sökande har en doktorsexamen i ’computational’ biologi, bioinformatik, fylogenomik, mikrobiella genomik, molekylär och/eller evolutionsbiologi eller närliggande områden. och bör företrädesvis ha Kunskap och erfarenhet ’i 'high-throughput’ genomiktechnologi inklusive metagenomik. Erfarenhet av att arbeta i en Linux/ Unix miljö samt god förmåga i användandet av programmeringsspråk såsom R, Python och/eller Perl krävs. Slutligen, goda kunskaper i engelska, talat liksom skrivet, är en förutsättning.

Sökande bör ha avlagt doktorsexamen inom tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl, kan doktorsexamen ha tilldelats tidigare (t.ex. ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, etc.). Ansökan ska innehålla tre kontaktuppgifter, en meritförteckning (CV), ett motivationsbrev (1 sida) samt en beskrivning av tidigare forskning (1 sida).

För ytterligare information om tjänsten kontakta Anja Spang, anja.spang@icm.uu.se.

Skicka in din ansökan senast 30 maj 2017, UFV-PA 2017/1421.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.