Postdoktor i molekylär evolution - mänskliga mikrobiomet

Uppsala universitet

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till ett av de 100 bästa universiteten i världen och en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 6 500 anställda och en omsättning på cirka 5,5 miljarder kronor.

Tvåårig anställning med tillträde snarast möjligt.

Vi studerar den molekylära evolutionen av bakteriers arvsmassor med hjälp av bioinformatiska analyser av nästa-generationens sekvensdata (NGS). Kunskapen är viktig för att förstå livets tidiga utveckling liksom även de mekanismer och selektionstryck som driver anpassningar till olika livsmiljöer. Ett viktigt område utgörs av studier av bakterier som infekterar människor. Vissa av dessa bakterier är sjukdomsalstrande, medan den stora majoriteten är harmlösa eller kanske till och med nyttiga. I vår egen tarmflora lever omkring två kg bakterier, som anses vara viktiga för kroppens ekobalans. Vår forskargrupp arbetar inom avdelningen för molekylär evolution och samverkar med forskare vid Science for Life Laboratory som är ett centrum för storskalig biovetenskap med fokus på forskning inom medicin och miljö: http://www.scilifelab.se

Arbetsuppgifter: Anställningen innefattar bioinformatiska studier med det övergripande målet att studera mikroorganismer som infekterar människor med hjälp av metagenomik och single cell genomik. Kliniska prover från olika patientgrupper kommer att utgöra underlag för analyserna. Med single cell genomik kommer forskaren att rekonstruera arvsmassorna från enskilda celler i proverna. Metagenomiska sekvenser rekryteras därefter till de rekonstruerade genomen för att studera den naturliga variationen, och mer specifikt för att jämföra mutations- och rekombinationsfrekvenser för olika arter och prover för att bättre förstå de evolutionära krafter som driver förändringar och adaptiva processer hos bakterier som infekterar människor. Projektet stöds av ett mångårigt anslag från Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse och kommer att bedrivas i samarbete med en forskargrupp som studerar virus från samma prover och leds av Björn Andersson vid Karolinska Institutet. Se http://ki.se/ki/jsp/polopoly.jsp?d=44239&a=150994&l=sv

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen i biologi specialisering mot bioinformatik, evolution och genomisk sekvensanalys. Erfarenhet av att arbeta i samarbetsprojekt som inkluderar forskargrupper från olika ämnesområden är önskvärt. Sökanden måste ha avlagt doktorsexamen högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare, till exempel vid ledighet på grund av t ex sjukdom eller föräldraledighet.

Lön sätts efter kompetens. Ange löneanspråk i ansökan.

Upplysningar om anställningen lämnas av professor Siv Andersson, e-post: siv.andersson@icm.uu.se, tel. 018-471 64 52,-43 79, eller prefekt Staffan Svärd, staffan.svard@icm.uu.se, tel. 018-471 45 58.

Välkommen med din ansökan senast den 24:e mars, 2014, UFV-PA 2014/584. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret.

Postdoktor i molekylär evolution - mänskliga mikrobiomet


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.