Postdoktor i molekylär- och systembiologi

Uppsala universitet

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till ett av de 100 bästa universiteten i världen och en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 6 000 anställda och en omsättning på cirka 5,5 miljarder kronor.

Tidsbegränsad anställning 2 år med tillträde snarast möjligt. Anställningen kan eventuellt följas av annan anställning efter överenskommelse.

Institutionen för cell-och molekylärbiologi är en av de mest internationella, breda och framstående biomolekylära institutionerna i Europa. Vid institutionen finns cirka 130 anställda fördelade på sex skilda forskningsprogram. Denna befattning är placerad i Måns Ehrenbergs forskargrupp (struktur- och molekylärbiologi). Arbetet kommer att utföras i nära sammarbete med professorerna Dan Andresson och Diarmaid, specialister inom bakteriefysiolog och molekylär evolution på institutionen för medicins biokemi och mikrobiologi, och med andra experter.

Bakgrund: När en population av mikrober utsätts för en miljöförändring måste den anpassa sitt proteom för snabb tillväxt i den nya miljön. En del av projektet syftar till att besvara frågan: ”Vilken är den bästa strategin för en bakterie att snabbt anpassa sitt proteom som svar på en miljöförändring?” Med hjälp av ett in silico-system, där bakteriemetabolismen beskrivs som ett nätverk av kopplade flöden, har vi utvecklat en första generationens modell för optimala strategier för proteomanpassning vid miljöombyten. Inom ramen för den modellen har vi definierat den bästa anpassningsstrategin in en föränderlig värld (Pavlov and Ehrenberg, PNAS, 2013).  Vi har också visat att under specifika omständigheter kan välkontrollerade bakteriella reglersystem anpassa proteomet med en hastighet som närmar sig den optimala.                                                                                                      

Arbetsbeskrivning:

(i) Prediktioner som genererats av den ovan beskrivna modellen kommer att testas experimentellt med hjälp av moderna mass-spektrometri och deep-sequencing-metoder. Arbetet kommer att involvera experiment, som utförts i sammarbete med externa sammarbetspartners, samt analys av experimentella data

(ii) Modellen skall också utvecklas teoretiskt för att inkludera även tillväxt av bakterier under förhållanden som ändras periodiskt. En viktig fråga rör hur organismer anpassar sitt proteom för att uppnå optimal tillväxt i en föränderlig värld. Dessa nya teorier kommer att testas experimentellt genom molekylär evolution av bakterier under förhållanden som ändras periodiskt på olika tidsskalor.

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen inom ett för projektet relevant område.  Erfarenhet av relevanta mikrobiologiska tekniker. Examen ska ha avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer etc.

Önskvärt samt meriterande: En stark akademisk bakgrund samt praktisk erfarenhet av forskning inom biokemi, mikrobiologi eller populationsgenetik. Experimentell samt viss teoretisk postdoc-erfarenhet inom området är viktigt. Erfarenhet av kvantitativ modellering av bakteriefysiologi är meriterande, men inget krav. Arbetet utförs i en tvärvetenskaplig miljö och du skall kunna fungera som en brygga mellan teori och experiment i sammarbete med övriga forskargrupper i projektet och med externa experter på bland annat masspektroskopi och deep-sequencing.

Ansökan skall innehålla:

- Personligt brev. En kort beskrivning av dina intressen och kvalifikationer för att bedriva forskning i detta projekt (max en sida).
- Meritförteckning (CV) med lista över relevanta publikationer.
- Examensbevis.
- Lista på referenspersoner med kontaktuppgifter samt ev. rekommendationsbrev.

Upplysningar om anställningen lämnas av Måns Ehrenberg, tel: 0704-332381, e-post: ehrenberg@xray.bmc.uu.se (skicka inte din ansökan hit) Web: www.ribocore.uu.se

Välkommen med din skriftliga ansökan senast den 20:e februari 2014, UFV-PA 2014/123. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret

Postdoktor i molekylär- och systembiologi


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.