Postdoktor i singel cell gene expression analysis

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 41 000 studenter, 6 500 anställda och en omsättning på 5,9 miljarder kronor.



En 2-årig postdoktoral forskartjänst finns i Jochen Wolfs forskningsgrupp vid Evolutionsbiologiskt centrum i Uppsala, Sverige, som del av ett projekt som finansieras av Europeiska forskningsrådet (ERC).

Bakgrund: Anställningen är en del av ett långsiktigt forskningsprogram om artbildningens genomik i ett fågelmodellsystem. Den europeiska hybridzonen mellan helsvarta kadaverkråkor och gråkråkor är ett exempel på artbildning som involverar färg-relaterade partnerval. Vi genererade de båda kråkornas genom för integrerad analys av populationsgenetisk data, transkriptom profiler och funktionell analys på färgmönster i fjäderdräkten. Vi fann att endast en liten väldefinierad del av genomet skiljer de två underarterna från varandra. Denna region är förknippad med skillnader i pigmenteringsgenernas genuttryck.

Projektet: RNA-seq data integreras över många celltyper och har dålig resolution gällande förståelsen för celltypers specifika skillnader i genuttryck. I kråkans system, är vi särskilt intresserade av melanocyternas uttrycksmönster, dessa celltyper ansvarar för melaninproduktion och slutligen för fjädrarnas färgmönster.  Den sökande kommer att använda analyser av in situ proxmity (mRNA ) ligation som har utvecklats av kollegor i Uppsala  (Larsson et al . 2010) att 1) få positionsinformation för genuttryck och 2) kvantifiera relativa mRNA koncentrationer i melanocytceller. Sökande kommer att etablera den här metoden på histologiska prober av växande fjädrar för att specifikt peka ut kandidatgenernas roll i melanogenesis (för mer information om metoden se http://www.igp.uu.se/research/molecular_tools / ola_soderberg/). För mer information http://www.ebc.uu.se/Research/IEG/evbiol/research/Wolf/.

Miljön. Evolutionsbiologiskt centrum (EBC) (http://www.ebc.uu.se/) är en av världens ledande forskningsinstitutioner inom evolutionsbiologi.  EBC är den del av Uppsala universitet som har rankats högst bland alla europeiska universitet inom ämnet biologi (CHE europeiska rangordning) och inkluderar en bred variation av discipliner. Den vetenskapliga miljön med många seminarier, journal clubs och sociala aktiviteter erbjuder utmärkta möjligheter för kontakter och samarbeten. En forskarskola för närvarande lett av Jochen Wolf ger en ram för kurser och seminarier som i stort sett återspeglar våra forskningsintressen (http://www.ebc.uu.se/education/postgrad/gradschool/Seminars). Vårt labb är en del av Institutionen för evolutionsbiologi (http://www.ebc.uu.se/Research/IEG/evbiol/), en aktiv miljö som behandlar grundläggande evolutionära frågor med ett brett spektrum av olika metoder. Som medlem i Science for Life Laboratory (http://www.scilifelab.se/) har vi tillgång till fantastiska datorresurser (https://www.uppmax.uu.se/uppnex) och en excellent bioinformatik infrastruktur (http://www.scilifelab.se/platforms/bioinformatics/). Vi samarbetar också aktivt med forskargrupper i det närliggande BioMedicalCentre (http://www.imbim.uu.se/Research). Labbet ligger i studentstaden Uppsala, som erbjuder rika möjligheter inom kultur-och friluftsliv. Sveriges huvudstad Stockholm är mindre än en timmes tågresa bort.

Kvalifikation: Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen eller har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, och som har avlagt examen högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare.

Meriterande: Den sökande har visat kunskaper i molekylära och histologiska tekniker, t. ex. Cyro - sektionering av svåra material; RNA in situ hybridisering, immunohistokemi, konfokalmikroskopi. Erfarenhet av kvantitativa metoder och in situ PLA en merit.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas. Ange löneanspråk i ansökan.

Upplysningar om anställningen lämnas av Jochen Wolf, jochen.wolf@ebc.uu.se.

Ansökan ska innehålla CV, motivering samt kontaktuppgifter till minst två referenser.

Välkommen med din skriftliga ansökan senast den 30 juni, 2014. UFV-PA 2014/1595. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret.

Postdoktor i singel cell gene expression analysis


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.