Postdoktor inom 3D-genomeanalys för att hitta samvariationssignaturer

Arbetsuppgifter
En post-doc-tjänst finns tillgänglig på gruppen av Assoc.

Prof. Pelin Sahlén vid SciLifeLab, KTH. Vi söker en mycket motiverad person för att arbeta inom området 3D-genomanalys och funktionell epigenomik inom det genommedicinska området. Vi kommer att arbeta tillsammans med topologisk dataanalysgrupp vid KTH under ledning av professor Wojciech Chachólski för att utveckla en ny analysmetod för att hitta samvariationssignaturer och den framgångsrika kandidaten kommer aktivt att samarbeta med Chachólski-gruppen.

Vi erbjuder en position i en ambitiös och resursstark grupp bestående av både wet-lab och beräkningsexpertis och forskare. Vår grupp fokuserar på samspelet mellan genomvariation och 3D-genom/kromatinarkitektur. Vi producerar högupplösta 3D-genom- och epigenomdataset från både kliniska och icke-kliniska prover för att utveckla banbrytande metoder med användning av genotypade genominteraktionsdataset.

Arbetsuppgifterna kommer att innefatta men inte begränsat till analys och integrering av multipla epigenom- och interaktomdataset, utveckla nya verktyg för att integrera DNA- och RNA-interaktionsdataset, bistå att utveckla arbetsflöden med hjälp av relevanta mjukvarupaket och databaser för icke-kodande variantprioritering, delta i designen wet-labbexperiment med kliniska prover.

Denna tjänst är en del av et samarbete mellan två av de största forskningsprogrammen i Sverige, Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, (WASP) samt SciLifeLabs och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (Data-Driven Life Science, DDLS). Målet är at lösa banbrytande tvärdisciplinära forskningsfrågor.

Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, WASP, är Sveriges största enskilda forskningsprogram i modern tid. Programmet skapar en platform för akademisk forskning och utbildning i nära samarbete med ledande svensk teknikintensiv industri. Forskningen innefatar artificiell intelligens och autonoma system som verkar i samarbete med människor och som anpassar sig till sin omgivning med hjälp av sensorer, information och kunskap och skapar intelligenta system av system. WASPs vision är excellent forskning och kompetens inom artificiell intelligens, autonoma system och mjukvara till gagn för svensk industri. Läs mer: https://wasp-sweden.org/

SciLifeLabs och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (Data-Driven Life Science, DDLS) är et 12-årigt initiativ fokuserat på datadriven forskning inom områden som är nödvändiga för at förbätra människors liv, upptäcka och behandla sjukdomar, skydda biodiversitet och skapa hållbarhet. Programmet kommer at utbilda och stöta nästa generation av forskare inom livsvetenskap och skapa en stark datavetenskaplig bas. Programmet avser stärka nationella samarbeten mellan universitet, koppla samman forskare inom livs- och datavetenskap samt at skapa samarbeten med industri, sjukvården och andra nationella och internationella aktörer. Läs mer: https://www.scilifelab.se/data-driven

Vi erbjuder
- En anställning på ett ledande tekniskt universitet som skapar kunskap och kompetens för en hållbar framtid
- Engagerade och ambitiösa kollegor samt en kreativ, internationell och dynamisk miljö
- Möjlighet att forska i en multidisciplinär, internationell forskning grupp

https://www.kth.se/om/work-at-kth/kth-your-future-workplace-1.49050

Kvalifikationer
Krav

- Avlagd doktorsexamen eller utländsk examen som bedöms motsvara en doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.
- Som person är du ambitiös och ha en stark initiativförmåga
- Erfarenhet av arbete med avancerade bioinformatikanalyser av storskalig genom eller omics-data
- Utmärkta programmeringsfärdigheter i minst ett av skripts eller programmeringsspråken Python, R eller C++ och erfarenhet att arbeta med storskalig datorkluster
- God förmåga i statistik
- Utmärkt muntlig och skriftlig språkfärdighet i engelska då det krävs i det dagliga arbetet
- God förmåga att både arbeta självständigt och samarbeta med kollegor

Meriterande

- Vid sista ansökningsdag högst tre år sedan doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen avlades.
- Erfarenhet av arbete med genominteraktion, epigenomiska datamängder eller genreglerande nätverk
- Erfarenhet inom området nätverksvetenskap och analys

Vi kommer att lägga stor vikt vid personliga egenskaper.

Fackliga representanter
Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på https://www.kth.se/om/work-at-kth/fackrepresentanter-1.500898.

Ansökan
Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time).

Om anställningen
Anställningen gäller tillsvidare, dock längst två år

En anställning som postdoktor är en tidsbegränsad meriteringsanställning med huvudinriktning mot forskning avsedd som ett första karriärsteg efter disputation.

Övrigt
Strävan efter jämställdhet, mångfald och lika villkor är både en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund.

För information om behandling av personuppgifter i samband med rekrytering läs mer här.


Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.



Om KTH

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, historia och filosofi. https://www.kth.se/om/om-kth-1.885102