Postdoktor inom beräkningsbiologi

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 54 000 studenter, mer än 7 500 anställda och en omsättning på cirka 8 miljarder kronor.




Vickovic Lab vid Uppsala universitet söker en dynamisk, självmotiverad, teamorienterad postdoktor beräkningsforskare för att utöka beräkningsinsatser för att förstå sjukdomsmekanismer.

Vi är intresserade av att utveckla integrerande multimodala dataanalysverktyg som inkluderar enkelcellsdata och rumsligt upplösta omicsdata, bilddata, kliniska fenotyper, varianter och genotyper. Den framgångsrika kandidaten kommer att ha den unika möjligheten att arbeta i skärningspunkten mellan matematisk modellering, omics dataanalys, arbetsflödesoptimering och resursbyggande. Vickovic Lab är fokuserat på att utveckla nya verktyg för "digital patologi" för att spåra sjukdomsprogression med syftet att identifiera översättbara läkemedel och terapeutiska mål i humana vävnadskohorter. Teamet utnyttjar teknologier inklusive rumslig transkriptomik, encellssekvensering och maskininlärning. Ett särskilt område av sjukdomsfokus för labbet är att utveckla verktyg för rumslig genomik som kommer att möjliggöra störande mycket komplexa interaktioner i människans tarm-till-hjärna-axel. Dr. Vickovic är också chef för teknologiinnovationslabbet vid New York Genome Center (NYGC). Personen som väljs ut för denna roll skulle också ha ett nära samarbete med NYGC-teamet, och det finns möjlighet att tillbringa en längre period i New York som gästforskare.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet: https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/.

Arbetsuppgifter
Ansvarsområden kan inkludera: Utveckla nya beräknings-, maskininlärnings- och statistiska analysmetoder för att integrera och analysera storskalig, rumsligt upplöst RNA-sekv och genotypisk data med hjälp av nuvarande toppmoderna teknologier; Utveckla dataanalysstrategier, skriv algoritmer och distribuera beräkningsverktyg för utforskning av mycket stora datamängder. Utveckla en resurs för samhället som ger tillgång till insamlad data; Arbeta nära med experimentella kollegor och kärnor för att förstå arten av genererad data; Aktivt delta i utarbetandet av manuskript för publicering och presentera vid vetenskapliga konferenser; Hjälpa till med kamrat- och studentmentorskap; och Dela expertis och ge utbildning och vägledning till gruppmedlemmarna vid behov.

Kvalifikationskrav
Doktorsexamen i beräkningsbiologi, beräkningsneurovetenskap, tillämpad matematik, datavetenskap eller relaterad disciplin krävs. Tidigare erfarenhet av Bayesiansk inferens, nätverksslutning och bildanalys är att föredra, men exceptionellt kreativa och drivna vetenskapsmän med intresse och anpassningsförmåga kommer att övervägas på allvar; Stark muntlig och skriftlig kommunikation, datadokumentation och presentationsförmåga krävs; Erfarenhet av att skriva vetenskapliga artiklar för publicering krävs; Förmåga att hantera flera projekt samtidigt krävs; och, Utmärkt samarbetsförmåga och interpersonell förmåga, samt vilja att arbeta i en högt tempo teammiljö krävs.

Önskvärt/meriterande i övrigt
För anställning som postdoktor ska du ha doktorsexamen med avhandlingsarbete på en internationell nivå av hög kvalitet inom ett ämne som är relaterat till annonsen. Examen ska ha avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan examen vara äldre än tre år. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer etc.

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad  i minst 2 och högst 3 år enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde: 19 juni eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Sanja Vickovic, 018 471 00 00, sanja.vickovic@igp.uu.se

Välkommen med din ansökan senast den 28 april 2023, UFV-PA 2023/1208.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.