Postdoktor inom cancersystembiologi

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 46.000 studenter, 7.300 anställda och en omsättning på 7,3 miljarder kronor.




Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet (http://www.

igp.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom medicinsk och klinisk genetik, klinisk immunologi, patologi, neuroonkologi, vaskulärbiologi, strålningsvetenskap samt molekylära verktyg. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar och masterprogram inom den medicinska fakulteten samt ett antal utbildningar inom teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Institutionen omsätter omkring 420 miljoner kronor, varav drygt hälften är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 345, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 700 verksamma i arbetsstyrkan. 

Arbetsuppgifter/Projektbeskrivning: Vi söker en postdoc inom bioinformatik, för ett projekt inom storskalig data-integration kopplat till studier av cancer i hjärnan. Inom ett delprojekt studeras integrativa nätverksanalyser av single cell-data, länkat till behandlingsförsök. Inom ett annat delprojekt studeras sambandet mellan morfologiska förändringar i celler (med hjälp av bildanalys, s.k. Cell Painting) och förändringar i geners expression (så kallad drugSEQ). Forskningen bedrivs i samarbete med experimentellt inriktade kollegor i vår grupp och med external partners i Sverige och Storbritannien. Som postdoc deltar man även i seminarier, konferenser och skriver vetenskapliga rapporter. Projektet stöds av ett SSF-konsortium, med partners i Stockholm, Göteborg och Lund.  

Kvalifikationskrav: För anställning som postdoktor ska du ha doktorsexamen, eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, i biomedicin, bioteknik, bioinformatik, systembiologi, statistik, eller angränsande ämne. Examen ska ha avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan examen vara äldre än tre år. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer etc.
Doktorsexamen inom relevant område.
Stark dokumenterad erfarenhet i programmering, helst i vanligt förekommande språk i fältet (R, Matlab, Python).
Stark dokumenterad erfarenhet av genomics-analyser, analyser av bilddata, eller andra former av 'data science'.
Dokumenterad förmåga att tolka, åskådliggöra och utveckla konkreta fynd i komplexa data.
Dokumenterad förmåga att samarbeta i team.
Dokumenterad förmåga att driva ett forskningsprojekt framåt.
Dokumenterat goda kunskaper i muntlig och skriven presentation på Engelska.

Önskvärt/meriterande i övrigt: Starkt intresse i akademisk forskning.
Erfarenhet av forskning inom cancer, systembiologi, genomics.
Erfarenhet inom konvex optimering, högdimensionell statistik.

Lön: Individuell lönesättning.

Tillträde: 2020-08-01 eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning i två år enl. centralt kollektivavtal.

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av: 


Sven Nelander, sven.nelander@igp.uu.se, tel: 018-471 4805
Cecilia Krona, cecilia.krona@igp.uu.se, tel. 018-471 4635.

Välkommen med din ansökan senast den 30 juni 2020, UFV-PA 2020/1403.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.