Postdoktor inom in situ sekvenseringsbaserad karakterisering av tumörer

vid Institutionen för biokemi och biofysik. Sista ansökningsdag: 2022-12-09.

SciLifeLab är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper med fokus på forskning inom hälsa och miljö. Centret kombinerar ledande teknisk expertis med avancerat kunnande inom translationellmedicin och molekylära biovetenskaper. SciLifelab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, KTH, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret samarbetar med flera andra lärosäten.

Administrativt kommer anställningen att placeras vid Institutionen för biokemi och biofysik, Stockholms universitet.

Projektbeskrivning
Rumsligt upplösat omik (spatial omics) är ett snabbt växande område som ger nya insikter i vävnaders och organs rumsliga organisation på molekylär nivå.

Enheterna för Targeted Spatial Omics (TSO) inom SciLifeLab Spatial and Single Cell Biology-plattformen har lanserats i år med uppgift att tillhandahålla in situ-sekvensering (ISS, PI: Mats Nilsson/Chika Yokota), single-moleule fluorescence in situ hybridization (smFISH, PI: Magda Bienko/ Xiaoze Li Wang) och multiplexed immunofluorescence (CODEX, PI: Emma Lundberg/Charlotte Stadler) till forskare över hela landet.

Plattformen har också till uppgift att utveckla nya analytiska förmågor, och det kommer bli den sökta postdoktorns huvuduppgift. Anställningen är nära kopplad till plattformens enheter och till forskningsgrupperna vid SciLifeLab som är pionjärer inom dessa rumsliga omikmetoder.

Med stöd av ett särskilt anslag från Vetenskapsrådet finns det en ledig plats för en postdoktor vid Mats Nilssons grupp inom spatial single-cell multi-omics. Syftet med projektet är att upprätta integrerade protokoll för TSO-teknik för att göra det möjligt för ett brett forskarsamhälle, särskilt inom bioteknik/läkemedel och sjukhus, att effektivt använda denna toppmoderna teknik. Projektet kommer att inriktas på att utveckla användbara analysmetoder för klinisk onkologisk forskning.

Arbetsuppgifter
Postdoktorn skall delta i forskningsprojekt och också aktivt delta och bidra till allmänna gruppaktiviteter och ansvarsområden. Till arbetsuppgiften hör att leda spatial omics projekt inom onkologi, särskilt för analys av bröstcancertumörer. Postdoktorn ansvarar för att etablera pipelines för analys av ISS och andra spatial omics data.

Behörighetskrav
Med postdoktor avses en arbetstagare som anställs i huvudsak för forskning och som har avlagt doktorsexamen eller har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen.

Bedömningsgrunder
Examen ska vara avlagd senast då anställningsbeslutet fattas, dock högst tre år före sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl, kan doktorsexamen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.

Vid tillsättningen kommer särskild vikt att fästas vid vetenskaplig skicklighet. Doktorsexamen skall ha gjort inom ett relevant fält, tex cellbiologi, molekylärbiologi, biokemi, biomedicinsk vetenskap, bioteknik, bioinformatik eller liknande. Den sökande skall också ha en läkarexamen eller liknande. Den sökande skall även vara tillräckligt flytande i Python och/eller R för att vara en avancerad användare av olika analyspaket med öppen källkod.

Tidigare arbete inom cancerforskning är ett krav, och klinisk erfarenhet är starkt meriterande. Kandidaten bör tycka om att lära sig nya metoder och bör kunna visa att han eller hon kan slutföra projekt inom en fastställd tidsram. Utmärkta kunskaper i interpersonella frågor, organisationsförmåga, kommunikationsförmåga och goda kunskaper i engelska är nödvändiga. Tonvikten kommer att läggas på ansvarstagande, flexibilitet, lagarbete och förmåga att lösa problem. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Anställningsvillkor
Anställningen avser heltid och gäller tills vidare, dock minst två år och högst tre år, med möjlighet till förlängning om det finns särskilda skäl. Tillträde enligt överenskommelse.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Kontakt
Upplysningar om anställningen lämnas av professor, Mats Nilsson, mats.nilson@scilifelab.se.

Fackliga företrädare
Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64, saco@saco.su.se, Alejandra Pizarro Carrasco (Fackförbundet ST/Lärarförbundet), tfn 08-16 34 89, alejandra@st.su.se, samt seko@seko.su.se (SEKO).

Ansökan
Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

När du ansöker ber vi dig att fylla i följande uppgifter


• dina kontakt- och personuppgifter
• din högsta examen
• dina språkkunskaper
• kontaktinformation för 2–3 referenspersoner

och att bifoga följande dokument


• personligt brev
• CV – examina och övriga utbildningar, arbetslivserfarenhet och publikationsförteckning
• projektplan/forskningsplan (bör ej överstiga 3 sidor) som beskriver:
– varför du är intresserad av det i annonsen beskrivna ämnet/projektet
– varför och hur du vill bedriva projektet
– vad som gör dig lämplig för det aktuella projektet
• kopia av bevis på doktorsexamen
• eventuella rekommendationsbrev (max 3 filer)
• egna publikationer som du önskar åberopa (max 3 filer).

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.

Välkommen med din ansökan!

Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.