Postdoktor inom Regleringsgenomik på Science for Life Laboratory, KTH

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, historia och filosofi.




Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH) är en av KTH:s fem skolor och en stark konstellation för forskning och utbildning inom de bredare ämnesområdena hälsa, miljö, material och energi.

Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa bedriver forskning och utbildning inom områden som rör flera globala samhällsutmaningar. Bland dem finns hållbar energi, hälsa och åldrande befolkningar, klimatförändringar, hållbar produktion och arbetsliv, livsmedelsproduktion och rent vatten.

Science for Life Laboratory (SciLifeLab, http://www.scilifelab.se/) är ett nationellt centrum för storskalig livsvetenskaplig forskning med en avancerad teknologisk infrastruktur. Vid SciLifeLab utförs multidisciplinär forskning baserad på DNA sekvensering, genexpressionanalys, proteomik, bioinformatik, biostatistik och systembiologi. Målsättningen är att göra det möjligt för svenska forskare att analysera gener, transkript och proteiner i olika organismer i avsikt att klarlägga molekylära mekanismer relaterade till hälsa och miljö. Exempel på tematiska forskningsområden som för närvarande bearbetas inom SciLifeLab är klinisk genomik/proteomik, cancergenomik och komplexa sjukdomars genomik samt ekologisk och miljörelaterad genomik.

Arbetsuppgifter

Pelin Sahléns labb studerar skillnad i funktion mellan DNA-sekvensvarianter i sjukdomar och evolution. Vi utvecklade en metod (HiCap) som ger högupplösta kartor över reglerande interaktioner för att hitta gener som är reglerade av sjukdomsrelaterade DNA-sekvensvarianter i olika celltyper. Vi har samlat en mycket stor mängd unika genetiskt och epigenetiskt data från flera individer och vävnader; vårt mål är att integrera olika lager av data för att modellera hur sekvensvarianter förändrar vissa processer som relaterar till hjärtsjukdomar. Vi letar efter en postdoktor som delar vår vision om att föra in kunskap om sekvensvarianter till kliniska tillämpningar. Den framgångsrika kandidaten kommer att vara ansvarig för att kombinera HiCap-data från flera vävnader och individer med andra typer av data. Projektet kommer att omfatta modellering och maskininlärning samt hantering och bearbetning av stora mängder interaktions, sekvensvariations och epigenetikdata.

Vi erbjuder

- Internationell arbetsplats.
- Ett ledande tekniskt universitet som skapar kunskap och kompetens för en hållbar framtid.
- Här får du kollegor med höga ambitioner i en öppen, nyfiken och dynamisk miljö.

Kvalifikationer

Krav

- Avlagd doktorsexamen i fysik, biofysik, tillämpad matematik, beräkningsbiologi alternativt ett relaterat fält (eller utländsk examen som bedöms motsvara en doktorsexamen), och som har avlagts högst tre år före ansökningstidens utgång.
- Mycket goda kunskaper i engelska, både i tal och skrift. 

Vi kommer att lägga stor vikt vid personlig lämplighet.

Meriterande

- Dataanalys av ”Big data”-set.
- Maskininlärning.
- Matematisk modellering.
- Erfarenhet inom HPC-miljön.
- Programmering i något av språken, C ++, Java, eller Python.
- Bayesiansk statistisk modellering och inferens.
- Vetenskaplig skicklighet.
- Pedagogisk förmåga.
- Muntlig kommunikativ förmåga. 
- Samarbetsförmåga.
- Självständighet.

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på https://www.kth.se/om/work-at-kth/fackrepresentanter-1.500898. 

Ansökan

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time). 

Tidsbegränsad anställning max till och med 28 02 2022

Om anställningen

Anställningen gäller tillsvidare dock längst två år.

En anställning som postdoktor är en tidsbegränsad meriteringsanställning med huvudinriktning mot forskning avsedd som ett första karriärsteg efter disputation.

Övrigt

Jämställdhet, mångfald och avståndstagande från alla former av diskriminering är både en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund.

För information om behandling av personuppgifter i samband med rekrytering läs mer här.


Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.