Postdoktor position i beräkningspatologi och bildanalys

Postdoktor position i beräkningspatologi och bildanalys

Arbetsbeskrivning

Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik (MEB) är bland de största institutionerna inom epidemiologi i Europa och har ett särskilt fokus på att fördjupa vår kunskap om olika sjukdomars orsak. Vår institution består av forskare, doktorander, biostatistiker, datainsamlare, databasadministratörer och administrativ personal, totalt cirka 250 anställda. Institutionen är belägen på campusområdet i Solna. Mer information finns på: ki.se/meb



Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Din roll
Detta postdoktorala projekt fokuserar på utveckling och validering av djupinlärningsmodeller och bildbehandlingsmetoder för cancerhistopatologibilddata.

Maskininlärning och djupinlärningstekniker är centrala i detta beräkningspatologiprojekt som syftar till att förbättra cancerpatientens stratifiering. Som postdoktor kommer du att vara involverad i implementering och utvärdering av maskininlärnings- / djupinlärningsmodeller och/eller bidra till utveckling av nya metoder och strategier inom domänen. Projektet bygger på unika och stora interna datamängder. Rollen skulle passa sökande som är intresserade av att utveckla en karriär i skärningspunkten mellan maskininlärning, epidemiologi och medicinska vetenskaper. Projektet Cancer Histopathology IMage Epidemiology (CHIME) fokuserar på storskaliga studier som inkluderar bilddata från histopatologi och klinisk information.

Gruppen för prediktiv medicin fokuserar på tillämpning av maskininlärning och AI för utveckling och validering av prediktiva modeller för biomedicinska applikationer, med ett särskilt intresse för cancerprecisionsmedicin och beräkningspatologi. Vår forskning bygger på stora och högdimensionella datamängder över flera modaliteter, inklusive molekylär, klinisk och medicinsk bilddata.

Detta är en position på 1 år med möjlighet till förlängning med 1 år.

Vem är du?
Behörig att anställas som postdoktor är den som har avlagt doktorsexamen eller har motsvarande vetenskaplig kompetens. Även sökande som inte avlagt doktorsexamen vid ansökningstidens utgång kan söka under förutsättning att alla krav för fullgjord examen uppfylls innan (avsett) anställningsdatum. Detta ska styrkas av sökandes huvudhandledare, studierektor eller motsvarande.

Vi tror att du antingen har en stark bakgrund inom datorvisionsforskning med djupinlärning och intresse för medicinsk forskning, eller att du har en bakgrund inom kvantitativ medicinsk forskning baserad på stora datamängder (t.ex. biostatistik eller epidemiologi) med forskningserfarenhet inom tillämpad bildanalys och djupt lärande. Den framgångsrika postdoktorn kommer att gå med i en tvärvetenskapligt forskargrupp med starkt samarbete med kliniska avdelningar och andra nationella och internationella forskargrupper.

För att kvalificera sig måste den sökande inneha eller förvänta sig att få en doktorsexamen (eller motsvarande) i ett relevant ämne och ha ett stort intresse för kvantitativa aspekter av medicinsk forskning. Förkunskaper och forskningserfarenhet inom ett relevant kvantitativt område (t.ex. maskininlärning, AI, epidemiologi, bildanalys, biostatistik, epidemiologi) krävs.

Det är önskvärt att kandidaten har tidigare erfarenhet från storskalig analys av biomedicinska data och/eller tillämpad maskininlärning/djupinlärning/AI. Tidigare erfarenhet från cancerrelaterad forskning eller medicinsk bildforskning är önskvärd. Den sökande ska ha tidigare kunskaper och erfarenhet av programmering i Python, och det är önskvärt att den sökande också har tidigare erfarenhet av att arbeta med gemensamma djupinlärningsramar, såsom Tensorflow/Keras eller Pytorch. Den sökande ska kunna samarbeta som en del av ett team såväl som självständigt och kunna organisera och prioritera sina egna uppgifter med minimal övervakning. Utmärkta skriftliga och muntliga kommunikationsförmåga på engelska krävs.

För ytterligare information kontakta docent Mattias Rantalainen (e-post: mattias. Rantalainen@ki.se)

Vad erbjuder vi?
En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Placering: Solna 



Ansökan
Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

- En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
- En komplett publikationslista
- En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan!

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. 


Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss

Kontaktpersoner på detta företaget

Gustaf Edgren, associate professor, gustaf.edgren@ki.se
+46-708-18 68 62
Sofia Anderberg, personalhandläggare, sofia.anderberg@ki.se
08 524 870 02
Ann Almqvist, OFR
08-524 861 99
Gunnar Stenberg, SEKO
08-524 880 75
Ulrika Zagai, SACO
08--524 871 84
Kamila Czene, Professor, e-mail: kamila.czene@ki.se

Professor Nancy Pedersen, e-post nancy.pedersen@ki.se
08-524 874 18
Prof. Kamila Czene, email: kamila.czene@ki.se
08-524 86144
Sara Hägg
08-524 822 36
Catarina Almqvist Malmros, Professor and Pediatrician, E-mail: catarina.almqvist@ki.se
+46 (0)70 116 0852

Sammanfattning

  • Arbetsplats: Karolinska Institutet, MEB
  • 1 plats
  • 6 månader eller längre
  • Heltid
  • Fast månads- vecko- eller timlön
  • Publicerat: 9 mars 2021
  • Ansök senast: 30 mars 2021

Besöksadress

Karolinska Institutet, Box 281
None

Postadress

Karolinska Institutet, Box 281
Stockholm, 17177

Liknande jobb


Bioinformatics Research Scientist

Bioinformatics Research Scientist

19 december 2024

18 december 2024

Postdoktor inom stamcellsbaserade modeller av schizofreni

Postdoktor inom stamcellsbaserade modeller av schizofreni

16 december 2024

13 december 2024