Postdoktor seriell kristallografianalys

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 56 000 studenter och 6 600 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid. 

Institutionen för kemi och molekylärbiologi bedriver högkvalitativ forskning och utbildning inom kemiska vetenskaper och molekylära livsvetenskaper. Vår forskning och utbildning fokuserar på en djup förståelse av kemiska och biologiska processer i celler och i miljön.

Vi tar oss an viktiga samhällsfrågor som till exempel antibiotikaresistens, cancer, hjärnsjukdomar, miljöproblem och klimatförändringar. På så sätt medverkar vi till att uppnå FN:s globala mål för hållbar utveckling inom områdena god hälsa och välbefinnande, hållbar energi för alla, hållbara städer och samhällen samt bekämpa klimatförändringar.

Institutionen är en internationell miljö med tvärvetenskapliga samarbeten inom både forskning och utbildning, och bidrar starkt till Göteborgs universitets topprankning inom life science.

Institutionen ansvarar för forskarutbildning inom ämnesområdet Naturvetenskap med inriktning mot kemi, biofysik, biologi och utbildningsvetenskap. Därtill är institutionen värd för utbildningsprogram i molekylärbiologi, genomik och systembiologi, kemi, organisk kemi och läkemedelskemi samt receptarieutbildningen. Institutionen samverkar med olika samhällsaktörer som skolor, näringsliv och myndigheter. Institutionen för kemi och molekylärbiologi har runt 200 anställda. Vi finns i centrala lokaler på Campus Medicinareberget i Göteborg. 

Neutze har arbetat med tidsupplöst seriell röntgenkristallografi av integrala membranproteiner med röntgenfria elektronlasrar sedan 2010. Både tidsupplöst seriell kristallografi och seriell synkrotronkristallografi är kraftfulla experimentella metoder som utvecklats för att studera proteinstruktur och funktion. Det har också nyligen gjorts stora investeringar i tidsupplöst seriell kristallografi av synkrotronstrålningskällor, inklusive dedikerade nya strållinjer vid MAX IV laboratoriet i Lund samt flera andra runt om i Europa (ESRF, Diamond och Swiss Light Source).

Det finns många utmaningar med att bearbeta seriella röntgenkristallografidata och beräkna högupplösta elektrondensiteter. Neutzes grupp har utvecklat flera verktyg för att underlätta tolkningen av tidsupplösta röntgendiffraktionsdata i form av proteinstrukturella förändringar och denna postdoktorala tjänst syftar till att fortsätta detta arbete.

Det fins många nya framsteg i användningen av maskininlärning verktyg för bearbetning och skalning av seriella röntgenkristallografidata, samt andra nya verktyg för att analysera tidsupplösta röntgenkristallografidata. Vi måste installera och använda dessa verktyg och utvärdera dem mot mer standardiserade sätt att bearbeta seriell kristallografidata. Flera projekt kan dra nytta av denna om analys inklusive tidsupplösta seriella kristallografi studier av cytokrom c-oxidas, fotosyntetiska reaktionscentra och sensoriskt rhodopsin II. Den framgångsrika kandidaten bör också vara flexibel i sin inställning till att tillämpa verktyg för maskininlärning på vetenskaplig data, och kommer att bli ombedd att bidra till teoretiska verktyg för studiet av informationsbearbetning i C. elegans, ett nytt projekt.

Vi söker därför att tillsätta en forskare med fokus på analys av seriella synkrotronröntgenkristallografi data. Den sökande måste kunna visa expertis i att bearbeta seriellkristallografi data. Den sökande måste vara skicklig i vetenskaplig datoranvändning med full behärskning av Linux-plattformar och kunna konstruera arbetsflödespipelines för hantering av stora datamängder. Erfarenhet av att använda maskininlärningsverktyg för att analysera dessa data är meriterande, men är inte nödvändigt då tjänsten handlar mer om tillämpning av befintliga verktyg snarare än att självständigt utveckla nya verktyg.

Arbetsuppgifter 
Vi avser anställa en postdoktor under två år som kan:


• Bearbeta tidsupplösta seriella kristallografidata med användning av synkrotronstrålning och Röntgenlaser.
• Implementera och använda verktyg för maskininlärning för att skala seriell kristallografidata för att förbättra kvaliteten på olika elektrondensitetsdata.
• Använda och utvärdera andra verktyg för att analysera seriellkristallografidata för att förbättra modelleringen av strukturella förändringar.
• Bidra till teoretiska verktyg för studiet av informationsbearbetning i C. elegans.

 

För att se annonsen i sin helhet samt ansöka vänligen gå till Göteborgs universitets hemsida för lediga jobb: https://www.gu.se/jobba-hos-oss/lediga-anstallningar 

 

Ansökan ska vara inkommen senast: 2024-12-02

 

Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning.

Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.