Postdoktor till Institutionen för skogsgenetik och växtfysiologi, SLU

Institutionen bildades i slutet av 70-talet när Skogshögskolan flyttade till Umeå. Antalet medarbetare har sedan dess stadigt ökat och uppgår idag till ett 100-tal, postdoktorer, gästforskare och doktorander inräknade. I slutet av 90-talet väcktes idén att bilda ett forsknings- och utbildningscenter i experimentell växtbiologi, Umeå Plant Science Centre (UPSC), tillsammans med institutionen för fysiologisk botanik vid Umeå universitet. Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi flyttade då in i lokaler i direkt anslutning till sin samarbetspartner, och de två institutionerna har numera ett mycket nära och framgångsrikt samarbete inom forskning och utbildning. Det internationella inslaget vid UPSC är stort med över 40 nationaliteter representerade.

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi bedriver forskning och utbildning i växtfysiologi, ekofysiologi, växtmolekylärbiologi, skogsgenetik och skogsbioteknik inom ramen för SLU's jägmästarprogram och på mastersnivå. Institutionen erbjuder även forskarutbildning inom dessa områden.
Mer information om Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi och UPSC hittar du på www.upsc.se.

Analys av förändringar i transkriptomen hos två dominerande arter i boreala skogar som resultat av förutsedda klimatförändringar

De boreala skogarna på nordliga latitude utgör världens näst största biom och ett av de viktigaste områdena för bindning av atmosfärisk koldioxid. De Europeiska delarna av denna biom domineras av de två arterna Pinus sylvestris (tall) och Picea abies (gran), vilka blivit viktiga resurser för regionens skogsindustrier. Då dessa skogar utmärker sig genom låg artrikedom bland träd, blir förståelse av de dominanta arternas reaktion på klimatförändringar särskilt viktig. Detta project kommer att utnjyttja transkriptomdata från granar och tallar, komplementeras med jämförbara studier av säsongsbetonade förändringar i dessa arters respons till förändrad tillgänglighet av kväve, och kopplade förändringar i svamptranskriptomiska analyser.

Arbetsuppgifter:
Planera och utföra transkriptomanalys av RNA-seq data insamlad från tall och gran, rötter och rotrelaterade svampar, följt av sammanställning av genererade data i vetenskapliga manuskript.

Kvalifikationer:
Kandidaten bör vara högt motiverad och en god lagspelare.  För att kvalificeras för tjänsten skall sökanden inneha en doktorsexamen inom ett för tjänsten relevant område, såsom skogsbiologi, växters molekylärgenetik eller växtbiokemi. Sökanden behöver kunna visa prov på kunskap och expertis med avseende på abiotiska stress-responser hos växter. Dokumenterade färdigheter inom bioinformatik är nödvändiga och sökanden bör ha erfarenhet av analys av next generation sequencing-data, körning av analyser på specialiserad datorinfrastruktur, tolkning av resultat av differentialla uttrycksanalyser, samt bevisad erfarenhet av att driva projekt från start till vetenskaplig publikation.  Utöver detta är tidigare erfarenhet med för projektet relevanta offentliga databaser för genomik och molekylärbiologi, samt god kunskap inom statistik t.ex. hypotestestning och berikningsanalys till sökandens fördel.  Ingående kunskap om, och färdigheter av, åtminstone ett relevant programmerings- och/eller scriptspråk, t.ex. R, Java eller Python är nödvändiga. Erfarenhet av datormodellering av co-expression nätverk och ontologier (särskilt gen-ontologier), kunskap om annotering av biologiska funktionsvägar och maskin-lärning för analys av transkriptomdata är nödvändigt för att lyckas i rollen. Rollen kräver utmärkta kunskaper (såväl skriftliga som muntliga) i engelska språket.

Anställningen är avsedd för en junior forskare och vi söker främst personer som avlagt doktorsexamen för högst tre år sedan.

Placering:
Umeå

Anställningsform:
Tidsbegränsad anställning 24 månader, med möjlighet till förlängning.

Omfattning:
100%

Tillträde:
2022-09-01

Ansökan:
Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast den 2022-08-24.

Fackliga kontaktpersoner:
https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/



Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) är ett universitet i internationell toppklass med forskning, utbildning och miljöanalys inom vetenskaper för hållbart liv. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. Hos oss samlas människor med olika perspektiv men med det gemensamma målet att skapa de bästa förutsättningarna för en hållbar, levande och bättre värld.

SLU har drygt 3000 medarbetare, 5000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över tre miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden.

www.slu.se