Postdoktor/Forskare

Förlängd ansökningstid

Postdoktor/Forskare

vid Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (IMBIM).Tidsbegränsad anställning fr o m snarast och upp till två år.

Projektbeskriving: Hunden är en unik modell för mänskliga sjukdomar.Hundar och människor får samma sjukdomar, har ungefär sammma gener och exponeras för en liknande miljö.Dessutom gör rasbildningen hos hundar att det är mycket lättare att hitta sjukdomsgener hos hundar än hos människor.I ett samarbete mellan Uppsala universitet, SLU , Broad Institute och samarbetsparteners inom Europa och USA bedrivs ett stort forskningsprogram för att hitta gener för cancer, autoimmuna, kardiologiska och neurologiska sjukdomar och för att följa upp dessa gener i humana patient material .

Arbetsbeskrivning: Att driva det bioinformatiska arbetet runt att hitta mutationer som orsakar sjukdomar och viktiga egenskaper hos hundar, samt att utforska motsvarande gener hos människor.Att driva det bioinformatiska utvecklingsarbetet runt ny sekvensteknologi inklusive att göra alignments och assemblies av sekvensdata från ny sekvensteknologi, samt att identifiera SNPar och göra analys både av genomvida data och av utvalda regioner.Delta i forskningsprojekt som syftar till att förklara den molekylära mekanismen för uppkomsten av sjukdomar hos hundar som modell för tumör och autoimmuna sjukdomar hos människa samt i att hitta "selective sweeps" hos hundar.Forskaren kommer att vara ansvarig för den bioinformatiska analysen och skall jobba med motsvarande experter i Norden för att synkronisera metoder rörande ny sekvensteknologi på Solexa och SOLiD sekvensning, samt jobba med andra forskare inom hund gruppen för att på effektivast möjliga sätt dra nytta av storlskalig sekvensanalys.Forskaren kommer också ha tillgång till data från SNP arrayer och CNV arrayer för detektion av associationer och kopietals mutationer.

Behörighetskrav: Disputerad forskare med erfarenhet av bioinformatiskt arbete.Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk DNA sekvensanalys är ett krav, samt en stark bakgrund i matematik, statistik och programmering.Viss molekylärbiologisk kunskap är en merit.God förmåga att kommunicera på engelska i tal och skrift är ett krav.

Den sökande skall vara ambitiös och mycket målinriktad.Det är av stor vikt att den sökande kan arbeta självständigt och driva projektet framåt, samt kunna interagera effektivt och smidigt med andra gruppmedlemmar och samarbetspartners.

Lön: Det är önskvärt att löneanspråk anges i ansökan.Lön sätts efter kompetens.

Ansökans utformning: Ansökan skall innehålla komplett CV med publikationslista.Kort beskrivning av tidigare forskning och forskningsintressen skall bifogas, samt namn och kontaktinformation till två personliga referenser.