Projektassistent i bioinformatik

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns cirka 44 000 studenter och mer än 8 000 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.


Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Institutionen för laboratoriemedicin (ILM) är en av sex institutioner vid Medicinska fakulteten. Vi bedriver ledande forskning inom det laboratoriemedicinska fältet med fokus på hur sjukdomar uppkommer och hur vi kan förbättra patienters diagnostik och behandling. Några av våra starkaste områden med forskning i världsklass, handlar om cancer-, genetik- och blodforskning.



Forskargruppen

Vid Avdelningen för klinisk genetik och inom forskargruppen ledd av professor Thoas Fioretos söker vi en projektassistent under 6 månader inom bioinformatik för ett forskningsprojekt finansierat av Vinnova.

Projektet syftar till att utveckla nya diagnostiska metoder för förbättrad precisionsmedicin vid akut leukemi och gliom baserat främst på RNA-sekevensering. Professor Fioretos forskargrupp består av ett 10-tal medarbetare med expertkunskaper inom genomik, funktionella studier och bioinformatisk analys. Det huvudsakliga syftet med forskningen inom forskagruppen är att erhållna kunskaper skall kunna användas för förbättrad klinisk diagnostik, uppföljning och behandling av patienter som insjuknar i leukemi. https://portal.research.lu.se/portal/sv/organisations-researchgroups/translational-genomic-and-functional-studies-of-leukemia(868a0f62-e3a7-42b7-a811-3e1f3ddad2b3).html kan du läsa mer om vår forskning.

Vi letar härmed efter en driven projektassistent som ska hjälpa oss med det pågående projektet i 6 månader. Anställningen är en tidsbegränsad heltidstjänst (100%) med önskat tillträdesdatum 1 september 2021 eller enligt överenskommelse.

Arbetsuppgifter

Ett av arbetspaketen inom det aktuella Vinnova-finansierade projektet syftar till att bygga upp en databas av publicerade studier där RNA-sekvensering har utförts av akuta leukemier och gliom. Datamängderna behöver kureras, normaliseras och därefter visualiseras på ett användarvänligt sätt så att forskare utan avancerade kunskaper inom bioinformatik kan tillgodogöra sig informationen. Du kommer att arbete i ett team bestående av cancerforskare med fokus på leukemi och gliom samt med forskare inom cancerbioinformatik.  Då projektet är Vinnova-finansierat och utgör ett samarbetsprojekt med Göteborgs universitet och ett mjukvaruföretag, kommer du att arbeta i ett utvidgat multidisciplinärt team. Projektet utgör vidare ett samverkansprojekt med forskare i Kina, varför du också kommer att samarbeta med internationella cancerforskare.

Kvalifikationer

För anställningen krävs:

- En kandidatexamen i molekylärbiologi eller relaterat område.
- Grundläggande examen inom biomedicin eller motsvarande.
- Examen på avancerad nivå inom bioinformatik motsvarande minst mastersexamen.
- Mycket goda laborativa kunskaper och erfarenhet av arbete med skevenseringsbaserade analyser och grundläggande molekylärbiologiska metoder.
- Mycket goda kunskaper inom bioinformatik och erfarenheter av bioinformatisk analys av RNA-sekvenseringsdata vid cancer
- Mycket goda kunskaper och erfarenheter av arbete och analys av data genererade inom ”The Cancer Genome Atlas (TCGA) project” med fokus på olika former av leukemi.
- Mycket goda kunskaper och erfarenheter av arbete med R, Python och Bash.
- Flytande i engelska, både i tal och skrift

Stor vikt läggs vid personliga egenskaper. Vi strävar efter att hitta en kandidat som är mycket motiverad, samarbetsvillig, initiativtagande och självständig.

Meriterande för anställningen är:

- Tidigare erfarenhet av arbete inom molekylär hematologi

Instruktioner för ansökan
Ansökan ska innehålla ett personligt brev där du beskriver hur du uppfyller eftersökta kvalifikationer, ett CV samt examensbevis.

Övrigt
Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Ange gärna löneanspråk i din ansökan.

Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Vi ser jämställdhet och mångfald som en styrka och tillgång. Välkommen med din ansökan! Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.