Systemutvecklare

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 54 000 studenter, mer än 7 500 anställda och en omsättning på cirka 8 miljarder kronor.




Institutionen för farmaci vid Uppsala universitet är en interdisciplinär miljö som är central inom läkemedelsområdet.

Med forskning i frontlinjen, utbildning i toppklass och omfattande samverkan med det omgivande samhället utgör vi en viktig motor i utvecklingen av det farmaceutiska området.

Våra vetenskapliga fokusområden i urval: Farmakodynamik, Farmakoekonomi, Farmakoepidemiologi, Farmakokinetik,  Farmakometri, Farmakoterapi, Galenisk farmaci och nanoteknologi, Klinisk farmaci, Läkemedelsformulering, Läkemedelstillförsel, Molekylär galenisk farmaci, Samhällsfarmaci. Mer information https://farmaci.uu.se/.

Forskargruppen i farmakometri utvecklar och underhåller flera olika mjukvarupaket som används inom forskningsfältet. Utvecklingen sker öppet och resultaten publiceras som öppen källkod. Innehållet i mjukvaruutvecklingen spänner över ett brett fält och innehåller beräkningar inom statisktik och linjär algebra, parsning och tolkning av olika filformat, parallellisering och grafisk presentation. För närvarande används Python och R för nyutveckling. De viktigaste paket gruppen arbetar med just nu är Pharmpy, PsN och diverse R-paket.

https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Arbetsuppgifter
Delta som system- och mjukvaruutvecklare i forskargruppen. Tillsammans med forskare utveckla och underhålla de olika open source-paket som forskargruppen tillhandahåller. Delta i projekt som drivs gemensamt med partners från läkemedelsindustrin eller andra samarbetspartners. Hjälpa forskare i gruppen att använda och förstå utvecklade system och att köra dem på olika beräkningskluster.

Nuvarande projekt syftar till att automatisera olika delar av den farmakometriska forskningsprocessen, framförallt att helt eller delvis automatisera byggandet av farmakometriska modeller. Vi arbetar med ”non-linear mixed effects”-modeller för olika typer av kliniska data skrivna i ett eller flera domänspecifika språk, framförallt NONMEM. Mer specifikt kommer systemutvecklare att, tillsammans med andra utvecklare och forskare, utveckla program som ska kunna skapa, transformera och utvärdera modeller.

Kvalifikationskrav
Ansökande ska ha universitetsexamen i ämne med anknytning till tjänsten (t.ex. civilingenjör eller datavetare) eller motsvarande kunskaper. Utöver detta krävs:

- Erfarenhet av programmering, gärna Python, R eller annat högnivåspråk
- Erfarenhet av att arbeta i Linux-system
- Erfarenhet av att arbeta med system för dokumentation och versionshantering
- God förmåga att uttrycka sig i tal och skrift på engelska.

Stor vikt läggs vid personlig lämplighet så som förmåga till självständigt arbete och god samarbetsförmåga.

Önskvärt/meriterande i övrigt
Erfarenhet av Pythons vetenskapliga stack: Sympy, Pandas, Numpy och Sphinx

- Erfarenhet av paketutveckling i Python eller R
- Kunskap inom matematik och matematisk statistik
- Erfarenhet av att använda HPC-resurser (högpresterande datorsystem)
- Erfarenhet av att utveckla parsers, grammatiker och syntaxträd
- Erfarenhet av maskininlärning
- Erfarenhet av att arbeta i mjukvaruutvecklingsteam
- Erfarenhet av utveckling av öppen källkod
- Erfarenhet av enhetstestning

Om anställningen 
Anställningen är tidsbegränsad, 15månader. Omfattningen är 100 %. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.

Upplysningar om anställningen lämnas av:  Professor Mats Karlsson, mats.karlsson@farmaci.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 18 maj 2022, UFV-PA 2022/1740.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.