Två-årig postdoktor vid SLU/ UPSC på ”scRNA sekvensering i aspved”

Institutionen bildades i slutet av 70-talet när Skogshögskolan flyttade till Umeå. Antalet medarbetare har sedan dess stadigt ökat och uppgår idag till ett 100-tal, postdoktorer, gästforskare och doktorander inräknade. I slutet av 90-talet väcktes idén att bilda ett forsknings- och utbildningscenter i experimentell växtbiologi, Umeå Plant Science Centre (UPSC), tillsammans med institutionen för fysiologisk botanik vid Umeå universitet. Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi flyttade då in i lokaler i direkt anslutning till sin samarbetspartner, och de två institutionerna har numera ett mycket nära och framgångsrikt samarbete inom forskning och utbildning. Det internationella inslaget vid UPSC är stort med över 40 nationaliteter representerade.

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi bedriver forskning och utbildning i växtfysiologi, ekofysiologi, växtmolekylärbiologi, skogsgenetik och skogsbioteknik inom ramen för SLU's jägmästarprogram och på mastersnivå. Institutionen erbjuder även forskarutbildning inom dessa områden.
Mer information om Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi och UPSC hittar du på www.upsc.se.

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi
Är en del av Umeå Plant Science Centre (UPSC) och ett forskningscentrum i Umeå (www.upsc.se) där forskning av både grundläggande och strategisk betydelse bedrivs. Forskningen vid UPSC bedrivs på alla organisationsnivåer av växten med ett gemensamt mål att förstå växten som en komplex organism i dynamisk interaktion med sin omgivning.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Arbetsuppgifter:
De vedartade vävnaderna i skogsträd bildas i de meristematiska vävnaderna i det vaskukära kambiet som delar sig för att bilda phloemvävnader utåt i stammen och xylemvävnader inåt i trädstammen. Vi har tidigare genomfört högupplösta transkriptomanalyser av vedartade vävnader i både asp och gran, vilket har resulterat i identifiering av vävnadsspecifika genuttrycksmönster och utrycksnätverk som är konserverade mellan de två arterna.  Dessa analyser utfördes i tangentiella kryosnitt av veden. I det aktuella projektet är målet att öka upplösningen av transkriptomanalyserna genom att isolera protoplaster från kambieregionen av aspträd, följt av RNA sekvensering av de enstaka protoplasterna.

Kvalifikationer:
Vi söker en mycket motiverad forskare med ett stort intresse för  transkriptomanalyser på encellig nivå. Framgångsrika sökande förväntas ha en doktorsexamen, erfarenhet av cell- och molekylärbiologi, single cell RNA sekvensering i träd och bioinformatik, FACS, samt dokumenterad forskningserfarenhet. Erfarenhet av växtprotoplaster och cellodlingstekniker är meriterande.

Anställningen är avsedd för en junior forskare och vi söker främst personer som avlagt doktorsexamen för högst tre år sedan

Placering:
Umeå

Anställningsform:
Tidsbegränsad anställning 24 månader, med möjlighet till förlängning.

Omfattning:
100%

Tillträde:
1 Juli eller enligt överenskommelse.

Ansökan:
Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast den 2023-04-27.

Fackliga kontaktpersoner:
https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/



Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) är ett universitet i internationell toppklass med forskning, utbildning och miljöanalys inom vetenskaper för hållbart liv. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. Hos oss samlas människor med olika perspektiv men med det gemensamma målet att skapa de bästa förutsättningarna för en hållbar, levande och bättre värld.

SLU har drygt 3000 medarbetare, 5000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över tre miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden.

www.slu.se