Två doktorander vid Centrum för bildanalys

Två doktorander vid Centrum för bildanalys.

Centrum för bildanalys (CBA) är ett samarbetsorgan för Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) och Uppsala universitet (UU). Samarbetet syftar till att genom forskning och utveckling skapa det kunskapsunderlag som krävs för ett operativt och förnuftigt utnyttjande av digital bildanalys i samhället. Läs mer om oss på http://www.cb.uu.se/. Vi söker nu två nya doktorander till CBA.

För båda anställningarna gäller: Lämplig bakgrund är civilingenjörsexamen eller annan naturvetenskaplig/teknisk grundexamen med inriktning mot datavetenskap, statistik och matematik. Erfarenhet av digital bildanalys är meriterande, liksom erfarenhet av respektive tillämpning. Arbetet innebär omfattande utveckling av programvara varför programmeringsvana också är en väsentlig merit.

Doktorandanställningar är främst avsedda för egen utbildning på forskarnivå. Förutom egen utbildning ingår medverkan i undervisning eller andra institutionsgöromål till en omfattning av ungefär 20%. För innehav av doktorandanställning krävs att innehavaren är eller blir antagen till utbildning på forskarnivå. Doktorandplatserna är tillgängliga omgående.

1) Analys av 2D transmissionselektronmikroskopibilder av virus vid UU i samarbete med Vironova AB (UFV-PA 2008/84)
Virus utgör ett reellt hot mot samhället idag, speciellt genom ökad globalisering och bioterrorism. Det här doktorandprojektet ingår som en del i ett större projekt där Vironova AB tillsammans med CBA och forskare från Smittskyddsinstitutet ska utveckla ett objektivt och automatiskt diagnostiksystem för snabb identifiering av virala agenser. Systemet baseras på bildanalys av elektronmikroskopibilder av patientprover innehållande virus. Virus detekteras och olika karaktäristiska egenskaper mäts i bilderna. Olika virusarter kan på så vis identifieras.

Vironova AB, är ett bioteknikföretag som utvecklar antivirala läkemedel samt metoder för analys och diagnostik av virus. Vironovas teknikplattform bygger på elektronmikroskopi i kombination med automatiserad bildanalys. Läs mer om Vironova på http://www.vironova.com/.

Doktoranduppgifterna består i att utveckla och testa metoder för detektion av virus i elektronmikroskopibilder; diskriminerande egenskapsmått; klassificeringsmetoder. Arbetet utförs i nära samarbete med bildanalytiker och systemutvecklare på Vironova AB samt virusforskare på smittskyddsinstitutet.

2) Analys av mikroskopibilder av celler vid UU (UFV-PA 2008/85)
Cancer detekteras och diagnostiseras främst genom granskning av mikroskopibilder av cellpreparat. Med hjälp av datoriserad bildanalys kan vissa typer av sådana granskningar göras mer automatiska eller mer objektiva och kvantitativa. Vi har tillsammans med andra grupper i världen forskat på detta område sedan början av 1970-talet men mycket finns kvar att göra. Dagens kraftfulla datorer och bildanalysmetoder ger nya möjligheter att skapa hjälpmedel som väsentligt kan förbättra cancerdiagnostik och detektion.

Vi söker nu en doktorand som kan delta i detta arbete. Arbetet består i att tillsammans med handledare och andra forskare inom såväl bildanalys som medicin utveckla och testa nya bildanalysmetoder för mikroskopiska cellbilder.

Ansökan till respektive anställning ska innehålla meritförteckning, övriga handlingar och en beskrivning av dig själv och varför du skulle vilja bli doktorand hos oss.