Upp till två doktorandtjänster inom datoriserad bildbehandling

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 44.000 studenter, 7.100 anställda och en omsättning på 7 miljarder kronor.




Denna doktorandtjänst är del av ett interdisciplinärt samarbete mellan institutionen för informationsteknologi och Science for Life Laboratory.

Institutionen för informationsteknologi har ca 300 anställda och bedriver forskning och utbildning i ett spektrum av områden inom datavetenskap och IT. Forskningen är organiserad i fem avdelningar. På avdelningen för visuell information och interaktion samlas en världsunik kombination av expertis inom datoriserad bildanalys och människa-datorinteraktion. Mer information om institutionen och dess verksamhet finns på http://www.it.uu.se/

Science for Life Laboratory, SciLifeLab, är ett svenskt nationellt centrum för molekylär biovetenskap med fokus på hälsa och miljöforskning. Centret kombinerar teknisk expertis i frontlinjen med avancerad kunskap om translationell medicin och molekylär biovetenskap. SciLifeLab är en nationell resurs som drivs av Karolinska Institutet, Kungliga Tekniska Högskolan, Stockholms universitet och Uppsala universitet, men samarbetet innefattar många fler universitet. SciLifeLab bildades 2010 och idag arbetar ca 1,500 personer inom centret (http://www.scilifelab.se/http://www.scilifelab.se/)).

Arbetsuppgifter/Projektbeskrivning: Digital avbildning av medicinska vävnadsprover och genetisk analys är två snabbt växande områden inom patologi. Målet för projekt, finansierat av Europeiska forskningsrådet (https://erc.europa.eu/), är att utveckla beräkningsmetoder för att brygga dessa två områden genom att kombinera spatialt upplöst genetisk analys av vävnadsprover med digital bildanalys av vävnadsmorfologi. Denna doktorand kommer vara inblandad i utvecklingen av avancerade metoder för storskaliga mikroskopiexperiment, digital bildbehandling och dataanalys, inklusive maskininlärningsmetoder så som deep learning, statistisk analys och visualisering. Kandidaten förväntas samarbeta med projektpartners, andra doktorander och examensarbetare, inklusive forskare från det biomedicinska området. Mer information om den pågående forskningen inom projektet finns här: https://tissuumaps.research.it.uu.se/

Kvalifikationskrav: För anställning som doktorand krävs en civilingenjörsexamen/MSc inom datavetenskap, teknisk fysik, bioinformatik, eller relaterade områden relevanta för forskningsuppgiften, excellenta studieresultat, speciellt inom matematik och maskininlärning, samt väl dokumenterad erfarenhet av algoritmutveckling och programmering.

En stark matematisk bakgrund och expertis i digital bildbehandling/bildanalys, maskininlärning och djupinlärning är krav. Bra kommunikationsförmåga på engelska, både muntlig och skriftlig, är ett krav.

Önskvärt/meriterande i övrigt: Erfarenhet av arbete med biomedicinska bilder är meriterande. Postdoktortjänsten är mycket interdisciplinär, och förståelse för/intresse av tillämpningar inom livsvetenskaperna och mikroskopi är meriterande.

Ansökningsförfarande: Ansökan ska innehålla ett brev där den sökande beskriver motiveringen till att söka denna tjänst, relevanta kvalifikationer och forskningsintressen. Ansökan ska också innehålla en meritförteckning (CV), med kopior av examensbevis och andra relevanta intyg och betyg, samt en länk till en elektronisk version av examensarbete och ev.  publikationer, samt kontaktinformation till två referenspersoner. Vi vill också veta tidigast möjliga startdatum. 

Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer http://regler.uu.se/.

Lön: Enligt lokalt kollektivavtal för doktorander.

Tillträde: Snarast eller enligt överenskommelse.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning, enl HF 5 kap § 7, i fyra år med möjlighet till förlängning upp till ett år genom institutionsgöromål så som undervisning (max 20%).

Anställningens omfattning: 100 %

Upplysningar om anställningen lämnas av: Professor Carolina Wählby, 018 4713473,  .

Välkommen med din ansökan senast den 30 mars 2020, UFV-PA 2020/810.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.


Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.