Utredare

Folkhälsomyndigheten är en nationell kunskapsmyndighet som arbetar för bättre folkhälsa. Det gör myndigheten genom att utveckla och stödja samhällets arbete med att främja hälsa, förebygga ohälsa och skydda mot hälsohot. Vår vision är en folkhälsa som stärker samhällets utveckling.

Till vårt Bioinformatik team på enheten för laboratorieutveckling söker vi en bioinformatiker. Har du ett par års relevant arbetslivserfarenhet av naturvetenskapliga branschområden inom data science, bioinformatik, bioteknik eller motsvarande där bioinformatiska analyser av sekvenseringsdata utgjort en väsentlig del? Då har du möjlighet att använda och utveckla din kompetens hos oss!

Vad ska du jobba med?
Dina arbetsuppgifter i teamet för bioinformatik kommer att innebära analys av data från sekvensering (NGS) samt utredningsarbete tillsammans med mikrobiologer inom myndighetens ansvarsområde. I dina arbetsuppgifter ingår programmering och utveckling såväl som avancerade beräkningar och visualiseringar av data. Vi använder oss av Nextflow som ramverk för utveckling av bioinformatiska arbetsprocesser och programmerar pipelines i framförallt Python och Java. Vidare använder vi containerbaserad teknologi och nyttjar Docker som plattform. Avseende integration använder vi företrädelsevis API:er och microtjänster. 

Dina arbetsuppgifter i teamet för bioinformatik innebär vidare att strukturera och kurera stora datamängder dvs. helgenomsekvenseringsdata och tillhörande metadata. I arbetsuppgifterna ingår att analysera genomisk data från bakterier, virus och parasiter från vår egen sekvenseringsplattform som har expanderat senaste året. Syftet är att bistå den nationella övervakningen av smittsamma sjukdomar.

Vi bedriver verksamheten i enlighet med gällande kvalitetsstandarder. Teamet och enheten tar ett helhetsansvar och säkerställer långsiktig förvaltning i linje med myndighetens uppdrag, att vara ett expertstöd vid hantering av misstänkta eller konstaterade utbrott av smittsamma sjukdomar.

Arbetet innebär även att du kan delta eller leda större eller mindre utvecklingsprojekt med bioinformatisk inriktning. Vi samarbetar tvärfunktionellt med andra experter som mikrobiologer, epidemiologer och IT-kollegor på myndigheten. Även samarbeten nationellt och internationellt förekommer. Du är en del av teamet och deltar i det dagliga arbetet i enhetens bioinformatiska team.

Vem söker vi?
Krav för anställningen


• minst tre års högskoleutbildning inom relevant område exempelvis bioinformatik, datavetenskap, systemvetenskap, mikrobiologi, molekylär bioteknik, eller motsvarande
• ett par års relevant arbetslivserfarenhet av naturvetenskapliga branschområden inom data science, bioinformatik, bioteknik eller motsvarande där bioinformatiska analyser av sekvenseringsdata utgjort en väsentlig del
• ett par års arbetslivserfarenhet av programmering i ett objektorienterat programmeringsspråk exempelvis i R, Java, Python eller C++
• en eller ett par års relevant arbetslivserfarenhet av Linux som miljö för analys av sekvenseringsdata och för databearbetning.

Utöver det ser vi dessa kompetenser, förmågor och erfarenheter som viktiga för att du ska trivas hos oss:

Mycket stor vikt läggs vid:


• doktorsexamen inom relevant område
• en eller ett par års dokumenterad arbetslivserfarenhet av reproducerbara analyser med ramverk som t.ex. Nextflow eller motsvarande
• en eller ett par års dokumenterad arbetslivserfarenhet av containerbaserad teknologi som t.ex. Docker eller motsvarande
• god förmåga i svenska och engelska, både tal och skrift
• Vi fäster mycket stor vikt vid de personliga egenskaperna såsom att vara ansvarstagande, självgående, analytisk och noggrann. Du är prestigelös och tycker om att samarbeta med kollegor. Du vet att man behöver anstränga sig för att förstå verksamheters behov och du kan väga samman olika intressen och leverera gemensamma prioriteringar.

Stor vikt läggs vid:


• en eller ett par års arbetslivserfarenhet av att arbeta kvalitetssäkert dvs. versionering av kod och tekniskt dokumentera utvecklingsarbetet
• dokumenterad erfarenhet av att bioinformatiskt analysera helgenom data av mikroorganismer eller metagenomiska prover
• dokumenterad erfarenhet av att presentera dataanalyser visuellt.

Vad gör enheten?
Enheten för laboratorieutveckling ger metodutveckling och kvalitetsstöd internt och externt. Ansvarar även för drift och utveckling av laboratoriemetodik och plattformar samt kundansvar och provadministration.

Hur är det att jobba på Folkhälsomyndigheten?
Vi erbjuder utvecklande arbetsuppgifter där du kan påverka och göra skillnad. Oavsett vad du jobbar med är du med och bidrar till samhällsnytta. Det gör du tillsammans med engagerade och kompetenta kollegor i stimulerande samarbeten. Folkhälsomyndigheten är en arbetsplats som strävar efter att ge lika möjligheter till alla och att vara fri från diskriminering. Myndigheten har sin verksamhet i Solna och Östersund.

Om anställningen
Du kommer att anställas som utredare med placering på vårt kontor i Solna. Befattningen är en tillsvidareanställning på heltid som inleds med sex månaders provanställning. Tillträde sker 2023-06-01 eller snarast enligt överenskommelse. Befattningen innebär krigsplacering.

På myndigheten kan det finnas möjlighet att teckna överenskommelse om distansarbete upp till 40% av din arbetstid.

Är du intresserad?
Vill du veta mer om anställningen är du välkommen att kontakta enhetschef Anna Risberg, telefon 010- 205 21 38.

Fackliga företrädare är för SACO Marlene Olsson Vargas, telefon 010-205 25 37, och för OFR/S Sujata Maini, telefon 010-205 22 73.

Ansökan
Välkommen med din ansökan till befattningen som utredare hos oss!
Vänligen ladda upp relevanta examensbevis i samband med din ansökan.

Ansök senast 2023-05-08 via myndighetens webbplats.
Arbetsgivarens diarienummer: 01674-2023-2.1.1